174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1583 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1314  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 		 532 aa  1073    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1583  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 		 532 aa  1073    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00561497 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  45.19 
 
 		 545 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  42.75 
 
 		 519 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  45 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  41.73 
 
 		 540 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  43.78 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  40.9 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  40.9 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  43.18 
 
 		 495 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  39.03 
 
 		 525 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  40.9 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  40.9 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  41.91 
 
 		 503 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  41.7 
 
 		 559 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  41.04 
 
 		 545 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  40.85 
 
 		 545 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  41.04 
 
 		 545 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  40.16 
 
 		 530 aa  361  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  38.52 
 
 		 534 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  42.12 
 
 		 544 aa  360  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  40.76 
 
 		 498 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  38.15 
 
 		 546 aa  354  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  40.72 
 
 		 503 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2353  glucan biosynthesis protein G  38.12 
 
 		 527 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0646222  hitchhiker  0.0000000102725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2425  glucan biosynthesis protein G  38.1 
 
 		 527 aa  349  8e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750815  hitchhiker  0.00489845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2597  glucan biosynthesis protein D  38.7 
 
 		 529 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000617652  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  37.45 
 
 		 529 aa  346  7e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2559  glucan biosynthesis protein G  39.05 
 
 		 529 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000572513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  38.14 
 
 		 527 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1785  glucan biosynthesis protein D  38.52 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000307117  hitchhiker  0.00000000192926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2514  glucan biosynthesis protein G  38.01 
 
 		 526 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0712053  hitchhiker  0.00000000245442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2731  glucan biosynthesis protein G  38.12 
 
 		 528 aa  342  9e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3200  glucan biosynthesis protein G  43.97 
 
 		 504 aa  341  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  40.77 
 
 		 539 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  40.57 
 
 		 539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  41.1 
 
 		 532 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  40.53 
 
 		 545 aa  335  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  40.5 
 
 		 519 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  39.96 
 
 		 522 aa  334  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  40.7 
 
 		 542 aa  334  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 		 498 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0301  glucan biosynthesis protein G  41.92 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3563  glucan biosynthesis protein G  43.17 
 
 		 513 aa  326  8.000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  44.93 
 
 		 579 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4171  glucan biosynthesis protein D  43.05 
 
 		 494 aa  323  7e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  42.47 
 
 		 642 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  41.06 
 
 		 604 aa  320  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  39.69 
 
 		 540 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  36.7 
 
 		 533 aa  320  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  39.96 
 
 		 533 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  39.54 
 
 		 588 aa  319  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  38.27 
 
 		 525 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  38.27 
 
 		 525 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  36.7 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  36.7 
 
 		 517 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  43.85 
 
 		 559 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  36.7 
 
 		 517 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  36.7 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  36.7 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  36.7 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  36.7 
 
 		 517 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  36.7 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  36.7 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  40.68 
 
 		 579 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  37.53 
 
 		 517 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  38.87 
 
 		 505 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  37.53 
 
 		 517 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  37.53 
 
 		 517 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  37.53 
 
 		 517 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  42.74 
 
 		 641 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  37.53 
 
 		 517 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  42.6 
 
 		 504 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  40.44 
 
 		 559 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  37.17 
 
 		 511 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  37.17 
 
 		 528 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  39.79 
 
 		 525 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0710  glucan biosynthesis protein D  38.8 
 
 		 530 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  41.3 
 
 		 530 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  41.3 
 
 		 520 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  37.27 
 
 		 534 aa  309  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  37.32 
 
 		 522 aa  309  9e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  37.32 
 
 		 522 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1804  glucan biosynthesis protein D  35.7 
 
 		 536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  37.88 
 
 		 534 aa  306  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  36.53 
 
 		 536 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  36.49 
 
 		 522 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  36.14 
 
 		 608 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  36.14 
 
 		 562 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  36.14 
 
 		 562 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  36.14 
 
 		 562 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  38.98 
 
 		 540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  38.98 
 
 		 540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  36.08 
 
 		 522 aa  303  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  36.83 
 
 		 568 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  35.54 
 
 		 597 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  36.29 
 
 		 594 aa  302  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  39.33 
 
 		 514 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  35.74 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  35.74 
 
 		 558 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>