More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1494 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 386 aa  776    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  33.76 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  35.26 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  34.95 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  34.49 
 
 		 402 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  38.19 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  32.05 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  34.17 
 
 		 496 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  37.64 
 
 		 374 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  37.5 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  30.79 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  34.24 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  35.28 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  33.42 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  34.12 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  32.51 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  35.19 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  31.93 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  32.13 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  34.46 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  34.05 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  33.43 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  32.28 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  33.85 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  30.42 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.42 
 
 		 398 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  34.71 
 
 		 393 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  34.4 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  32.89 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  32.89 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  32.89 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  30.57 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.82 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  31.22 
 
 		 396 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.06 
 
 		 403 aa  135  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  27.98 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  29.03 
 
 		 370 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  32.81 
 
 		 393 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  31.17 
 
 		 424 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  30.08 
 
 		 423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  30.62 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  29.66 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  33.96 
 
 		 398 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  31.71 
 
 		 404 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  31.25 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  31 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  30.62 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  31.47 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  33.16 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  31.23 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  29.21 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  26.04 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  31.12 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  31.36 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  29.33 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  29.19 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  31.75 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  30.99 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  29.79 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  27.73 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  29.56 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  27.47 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  29.37 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  28.42 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  29.85 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  28.7 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  30.33 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  28.39 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  26.65 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  30.8 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.86 
 
 		 404 aa  92.8  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  27.57 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  31.33 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  31.27 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.36 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  27.68 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  29.52 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.08 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  29.48 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  26.63 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  30.19 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  29.09 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  29.39 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.75 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  27.63 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  26.19 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  27.11 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  29.74 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.21 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  25.19 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  27.36 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  25 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>