167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1391 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1391  BolA family protein  100 
 
 		 80 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45441  normal  0.295987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0893  BolA family protein  83.75 
 
 		 80 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0866848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2952  BolA-like protein  82.5 
 
 		 80 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1597  BolA family protein  81.25 
 
 		 80 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0816624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2172  BolA-like protein  68.75 
 
 		 78 aa  113  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1117  BolA-like protein  68.75 
 
 		 78 aa  110  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1712  hypothetical protein  67.09 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1309  BolA-like protein  62.5 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1276  BolA-like protein  65.82 
 
 		 77 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1637  BolA-like protein  62.5 
 
 		 77 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3710  BolA-like protein  62.5 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2390  BolA family protein  63.75 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1789  BolA family protein  62.5 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1755  BolA-like protein  62.5 
 
 		 78 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0836  bolA-related protein  62.5 
 
 		 77 aa  100  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0828  bolA-related protein  62.5 
 
 		 77 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.775984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2145  BolA family protein  62.5 
 
 		 77 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230515  normal  0.346751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0186  BolA family protein  62.5 
 
 		 78 aa  100  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.49621  normal  0.367892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1935  BolA family protein  62.5 
 
 		 77 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0009  BolA family protein  61.25 
 
 		 78 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4711  BolA family protein  61.25 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1594  BolA-like protein  60 
 
 		 78 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  61.25 
 
 		 77 aa  97.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0864  BolA family protein  62.03 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1939  BolA/YrbA family protein  60 
 
 		 78 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1506  BolA family protein  61.25 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935248  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0124  BolA family protein  56.25 
 
 		 77 aa  95.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5397  hypothetical protein  57.5 
 
 		 79 aa  93.2  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0006  BolA family protein  56.25 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0011  BolA family protein  56.25 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0356  BolA-like protein  57.5 
 
 		 77 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4089  BolA family protein  56.25 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0012  BolA family protein  56.25 
 
 		 78 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0013  BolA family protein  56.25 
 
 		 78 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0874253  normal  0.885333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5884  hypothetical protein  56.25 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206517  normal  0.559405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1126  BolA family protein  55 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2520  BolA-like protein  58.23 
 
 		 77 aa  87.8  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269004  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0707  BolA-like protein  59.74 
 
 		 77 aa  87.4  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2585  BolA family protein  56.25 
 
 		 78 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6655  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  56.25 
 
 		 77 aa  84.3  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3118  BolA family protein  52.5 
 
 		 77 aa  83.6  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3464  BolA family protein  53.16 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1185  BolA family protein  47.5 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.234576 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0303  BolA family protein  42.11 
 
 		 73 aa  68.9  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.321518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  44 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  38.46 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  42.67 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  38.46 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0700  BolA-like protein  39.47 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.088559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0263  BolA family protein  37.18 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0466064  normal  0.451976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  39.74 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1417  BolA family protein  39.73 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.415851  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10771  BolA-like protein  41.67 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.42913 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09531  BolA-like protein  37.66 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.336163 
 
 
-
 
NC_002978  WD0490  hypothetical protein  36.84 
 
 		 72 aa  60.1  0.000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.529866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  40.85 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1660  BolA family protein  38.89 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  36 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  36.36 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  37.33 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  38.46 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  43.1 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  37.33 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  37.66 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  37.66 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  31.17 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  32.47 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14721  BolA-like protein  35.06 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0966227  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  37.66 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0676  BolA family protein  40.51 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  37.66 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  37.66 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0640  BolA-like protein  35.06 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2781  BolA-like protein  35.06 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158221  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  36.36 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  36.36 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  36.36 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  35.06 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  35.06 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  35.06 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2050  BolA family protein  37.97 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0762  hypothetical protein  39.24 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  40.51 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  31.17 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  41.82 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  35.06 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  31.17 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  33.77 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  36.71 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1822  BolA family protein  37.97 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  36.36 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0204  BolA family protein  36.71 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0507648  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26832  predicted protein  36.99 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.28154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1611  BolA family protein  44.64 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  39.74 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0986  BolA-like protein  33.33 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  35.44 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0696  BolA family protein  32.89 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00104448  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1481  BolA  32.89 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.491257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>