More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1205 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1205  urease accessory protein UreG  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  83.41 
 
 		 207 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  82.93 
 
 		 207 aa  333  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  82.44 
 
 		 207 aa  331  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  79.4 
 
 		 202 aa  317  7e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1756  urease accessory protein UreG  78.39 
 
 		 203 aa  314  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0086861  normal  0.860103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  68.5 
 
 		 203 aa  283  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_004310  BR0273  urease accessory protein UreG  65.84 
 
 		 208 aa  278  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0287  urease accessory protein UreG  65.35 
 
 		 208 aa  278  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  67.34 
 
 		 203 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0338  urease accessory protein UreG  65.67 
 
 		 206 aa  277  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  68.84 
 
 		 204 aa  275  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  66.83 
 
 		 213 aa  274  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  66.83 
 
 		 203 aa  274  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  68.84 
 
 		 204 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  67 
 
 		 204 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3468  urease accessory protein UreG  66 
 
 		 203 aa  270  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  67.84 
 
 		 204 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  67.84 
 
 		 204 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1179  urease accessory protein UreG  63.55 
 
 		 213 aa  268  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.585829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  66.5 
 
 		 205 aa  268  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  61.06 
 
 		 213 aa  267  8.999999999999999e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  63.82 
 
 		 203 aa  266  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2687  urease accessory protein UreG  64.5 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  67.51 
 
 		 211 aa  265  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  63.68 
 
 		 206 aa  262  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  64.68 
 
 		 202 aa  261  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  64 
 
 		 204 aa  259  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4708  urease accessory protein UreG  62.19 
 
 		 209 aa  258  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1384  urease accessory protein UreG  63.32 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  62 
 
 		 206 aa  258  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  62.69 
 
 		 210 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  61.54 
 
 		 217 aa  257  8e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  64.25 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  63.5 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.199977 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  65.28 
 
 		 201 aa  254  8e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  62.19 
 
 		 204 aa  254  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2768  urease accessory protein UreG  61.34 
 
 		 205 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  60.61 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  60 
 
 		 200 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3261  urease accessory protein UreG  62.31 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  60.7 
 
 		 204 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  62.94 
 
 		 216 aa  251  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  63.13 
 
 		 225 aa  251  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  60.7 
 
 		 204 aa  250  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  59.7 
 
 		 204 aa  250  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  60.19 
 
 		 211 aa  250  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  62.56 
 
 		 203 aa  249  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0418  urease accessory protein UreG  63.96 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0867  urease accessory protein UreG  63.96 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0897  urease accessory protein UreG  63.96 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2493  urease accessory protein UreG  63.45 
 
 		 215 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0787  urease accessory protein UreG  63.45 
 
 		 215 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4003  urease accessory protein UreG  62.94 
 
 		 215 aa  248  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0776  urease accessory protein UreG  63.45 
 
 		 215 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  58.91 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0971  urease accessory protein UreG  61.08 
 
 		 218 aa  248  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  58.29 
 
 		 201 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1723  urease accessory protein UreG  61.88 
 
 		 225 aa  247  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  61.19 
 
 		 201 aa  247  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1493  urease accessory protein UreG  62.94 
 
 		 216 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  59.47 
 
 		 202 aa  246  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1347  urease accessory protein UreG  60.89 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03470  urease accessory protein UreG  58.64 
 
 		 203 aa  245  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  62.94 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2554  urease accessory protein UreG  62.94 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0720  urease accessory protein UreG  62.94 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3115  urease accessory protein UreG  62.94 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3079  urease accessory protein UreG  62.94 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  62.94 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  62.69 
 
 		 203 aa  244  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3138  urease accessory protein UreG  62.44 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0684  urease accessory protein UreG  57.59 
 
 		 203 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0998  urease accessory protein UreG  63 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0561  urease accessory protein UreG  60.8 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562305  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1030  urease accessory protein UreG  64.18 
 
 		 202 aa  242  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190155 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  56.22 
 
 		 203 aa  241  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3408  urease accessory protein UreG  59.41 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  59.47 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  56.85 
 
 		 203 aa  238  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  57.89 
 
 		 212 aa  238  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4911  urease accessory protein UreG  58.71 
 
 		 205 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4453  urease accessory protein UreG  59.3 
 
 		 205 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0964  urease accessory protein UreG  62 
 
 		 207 aa  236  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0360581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0395  urease accessory protein UreG  56.02 
 
 		 204 aa  235  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3659  urease accessory protein UreG  54.97 
 
 		 205 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.319946  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0246  urease accessory protein UreG  56.54 
 
 		 205 aa  235  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7005  urease accessory protein UreG  62 
 
 		 207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.896739 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2360  urease accessory protein UreG  55.9 
 
 		 204 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.553398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2317  urease accessory protein UreG  55.9 
 
 		 204 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.301422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0585  urease accessory protein UreG  62.94 
 
 		 214 aa  231  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.084211 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1874  urease accessory protein UreG  54.87 
 
 		 204 aa  230  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2181  urease accessory protein UreG  60.87 
 
 		 206 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  53.47 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1858  urease accessory protein UreG  60.33 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.801773  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0663  urease accessory protein  62.69 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2451  urease accessory protein UreG  56.92 
 
 		 219 aa  228  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.296243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2029  urease accessory protein  60.32 
 
 		 210 aa  227  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133283 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0474  urease accessory protein UreG  55.21 
 
 		 206 aa  227  9e-59  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  55.96 
 
 		 205 aa  224  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>