118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1136 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1136  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  332  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  69.62 
 
 		 163 aa  236  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4791  hypothetical protein  69.62 
 
 		 165 aa  229  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  67.27 
 
 		 166 aa  228  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  68.35 
 
 		 165 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  67.09 
 
 		 165 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  70.97 
 
 		 166 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  67.74 
 
 		 165 aa  220  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  67.74 
 
 		 168 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  65.45 
 
 		 165 aa  217  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4247  protein of unknown function DUF892  70.32 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1820  hypothetical protein  66.67 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1737  hypothetical protein  69.03 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.997374  normal  0.0699743 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0468  hypothetical protein  66.67 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  67.74 
 
 		 166 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3057  hypothetical protein  66.67 
 
 		 165 aa  200  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.460854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4295  hypothetical protein  67.31 
 
 		 167 aa  200  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  55.35 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  62.82 
 
 		 164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4912  hypothetical protein  65.62 
 
 		 164 aa  194  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  60.13 
 
 		 192 aa  191  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  66.67 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  59.6 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  59.21 
 
 		 175 aa  187  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2670  hypothetical protein  62.89 
 
 		 167 aa  185  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0525668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  61.82 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9043  hypothetical protein  61.25 
 
 		 165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4293  protein of unknown function DUF892  57.67 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2862  protein of unknown function DUF892  58.86 
 
 		 168 aa  177  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.217094  normal  0.674493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5257  protein of unknown function DUF892  58.79 
 
 		 162 aa  177  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3614  hypothetical protein  58.02 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3906  protein of unknown function DUF892  58.02 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1470  hypothetical protein  54.43 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  53.8 
 
 		 168 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  52.17 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  51.9 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2066  hypothetical protein  52.17 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0139243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  51.85 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3827  hypothetical protein  63.11 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4071  hypothetical protein  54.37 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0479613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  57.69 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  52.87 
 
 		 180 aa  160  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  53.16 
 
 		 168 aa  159  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1633  hypothetical protein  60.13 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.351952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  51.27 
 
 		 198 aa  158  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5546  hypothetical protein  52.53 
 
 		 168 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376366  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2390  protein of unknown function DUF892  52.87 
 
 		 196 aa  157  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421917  normal  0.147329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3832  hypothetical protein  54.19 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  57.59 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  56.33 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  56.33 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1657  hypothetical protein  52.26 
 
 		 168 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448276  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  55.7 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  53.5 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  47.53 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0088  ycfI, putative structural proteins  53.8 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1724  hypothetical protein  53.8 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  48.1 
 
 		 217 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  50.65 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1678  hypothetical protein  52.53 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  47.74 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  45.68 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  45.68 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  46.91 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  43.67 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3141  hypothetical protein  45.57 
 
 		 189 aa  137  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0036  hypothetical protein  47.02 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  45.06 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  45.06 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  45.06 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  44.44 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  44.67 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4158  protein of unknown function DUF892  46.25 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  45.95 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  44.94 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  45.51 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  45.51 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0111142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  45.51 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  45.51 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  45.51 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  45.51 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  45.51 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  45.51 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  46.01 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  42.67 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  46.71 
 
 		 421 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5574  protein of unknown function DUF892  42.77 
 
 		 183 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  46.5 
 
 		 247 aa  127  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5097  hypothetical protein  46.91 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2545  hypothetical protein  43.87 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  44.44 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3186  hypothetical protein  44.79 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1026  hypothetical protein  46.3 
 
 		 187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.158329  hitchhiker  0.000105516 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  40 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5857  protein of unknown function DUF892  40.25 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0615276  normal  0.702479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2297  hypothetical protein  41.98 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  38.31 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5840  protein of unknown function DUF892  54.63 
 
 		 253 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3344  protein of unknown function DUF892  41.51 
 
 		 212 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0480671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1999  protein of unknown function DUF892  35.86 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>