79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1119 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  100 
 
 		 222 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  67.12 
 
 		 226 aa  293  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  63.68 
 
 		 225 aa  273  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  39.29 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  38.12 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  39.81 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  45.37 
 
 		 244 aa  134  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  45 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  38.39 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  43.89 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  43.44 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  41.36 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  41.96 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  39.05 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  44.29 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  42.59 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  40.37 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  42.73 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  40 
 
 		 229 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  42.53 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  40.81 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  38.57 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  40.99 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  40.29 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  37.05 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  35.84 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  32.2 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  39.11 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  32.7 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  33.64 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  32.2 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  35.1 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.92 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  39.37 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  28.64 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.31 
 
 		 242 aa  85.1  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  36.32 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  34.13 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  35.21 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  35.64 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.6 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  35.21 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.86 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.82 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  27.43 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  34.43 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.99 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  26.09 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.95 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.62 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.85 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.16 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.92 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  32.03 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  34.62 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.55 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  29.47 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  26.9 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.76 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.45 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.64 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.72 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.09 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.19 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.95 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  28.15 
 
 		 439 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.39 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  28.15 
 
 		 439 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  32 
 
 		 447 aa  47  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.37 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  28.36 
 
 		 443 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  27.41 
 
 		 443 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.71 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.2 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.53 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  26.9 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.01 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.34 
 
 		 190 aa  42  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  27.23 
 
 		 236 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>