158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1062 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
180 aa  363  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  71.11 
 
 
180 aa  277  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  70 
 
 
180 aa  275  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  66.11 
 
 
180 aa  261  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  65.36 
 
 
180 aa  259  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  63.89 
 
 
180 aa  258  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  65.56 
 
 
185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.89 
 
 
176 aa  169  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  47.73 
 
 
176 aa  168  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  47.43 
 
 
182 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  47.22 
 
 
176 aa  165  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  48 
 
 
185 aa  159  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  41.95 
 
 
186 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  41.38 
 
 
177 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  43.09 
 
 
177 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  40.91 
 
 
178 aa  148  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  40.78 
 
 
188 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.78 
 
 
186 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  42.61 
 
 
178 aa  140  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.2 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.98 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.11 
 
 
185 aa  131  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  38.07 
 
 
184 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  36.72 
 
 
185 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  37.82 
 
 
160 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  30.17 
 
 
195 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.86 
 
 
194 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.38 
 
 
123 aa  95.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.63 
 
 
215 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  31.38 
 
 
208 aa  92  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.33 
 
 
160 aa  92  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  28.57 
 
 
202 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  31.05 
 
 
199 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  34.41 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  29.19 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  34.08 
 
 
194 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  29.05 
 
 
204 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.61 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.61 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.79 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.06 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.86 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.21 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.78 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  28.89 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.77 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.03 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  27.03 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  27.03 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  29.35 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  29.35 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  29.35 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  27.94 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  28.89 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.33 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.28 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  28.38 
 
 
162 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  31.36 
 
 
195 aa  62  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  29.5 
 
 
216 aa  62  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.32 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  30.83 
 
 
200 aa  61.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  31.67 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  31.67 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.34 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  24.16 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.75 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  25.7 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  25.7 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  21.79 
 
 
198 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  26.23 
 
 
192 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  25.14 
 
 
196 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  29.57 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  31.62 
 
 
189 aa  57.8  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  31.97 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.16 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  24.58 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  23.6 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.77 
 
 
215 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  22.53 
 
 
194 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  25.14 
 
 
197 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  21.55 
 
 
194 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  21.55 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  27.73 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  28.81 
 
 
214 aa  54.3  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.67 
 
 
186 aa  54.3  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0685  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  27.43 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.957986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.03 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  27.73 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  31.4 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.3 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  30.22 
 
 
203 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  24.59 
 
 
205 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.93 
 
 
194 aa  51.2  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.7 
 
 
190 aa  51.2  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  27.68 
 
 
169 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.77 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  34.78 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>