More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1037 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  100 
 
 		 405 aa  828    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  58.66 
 
 		 408 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  51.83 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  49.38 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  49.26 
 
 		 412 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  49.39 
 
 		 411 aa  356  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  47.67 
 
 		 420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  49.51 
 
 		 414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  49.1 
 
 		 413 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  46.44 
 
 		 413 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  49.1 
 
 		 413 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  48.18 
 
 		 411 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  46.75 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  46.59 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  46.45 
 
 		 416 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  46.1 
 
 		 419 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  45.83 
 
 		 436 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  46.08 
 
 		 418 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  45.45 
 
 		 411 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  48.92 
 
 		 405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  47.92 
 
 		 413 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  43.98 
 
 		 445 aa  316  6e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  43.03 
 
 		 411 aa  307  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  45.1 
 
 		 461 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  43.8 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  40.87 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  43.56 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  43.14 
 
 		 443 aa  297  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  40.38 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  43.14 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  40.73 
 
 		 406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  44.19 
 
 		 393 aa  276  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  40.39 
 
 		 413 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  41.38 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  41.09 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  39.4 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  36.19 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  37.68 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  34.69 
 
 		 440 aa  235  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  38.3 
 
 		 447 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  33.65 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  34.69 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  37.01 
 
 		 426 aa  225  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  34.84 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  36.62 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  34.44 
 
 		 451 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  35.17 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  36.71 
 
 		 434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  34.27 
 
 		 445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  35.63 
 
 		 486 aa  216  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  33.49 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  34.59 
 
 		 426 aa  209  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  33.49 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  37.37 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  33.41 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  32.7 
 
 		 482 aa  200  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  31.28 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  32.61 
 
 		 407 aa  196  6e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  31.88 
 
 		 447 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  33.33 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.99 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  33.8 
 
 		 407 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  30.99 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  34.68 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  33.02 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.33 
 
 		 421 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  29.83 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  35.15 
 
 		 419 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33 
 
 		 430 aa  182  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  29.98 
 
 		 413 aa  182  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  32.55 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  32.71 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  32.7 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.7 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  32.7 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.22 
 
 		 412 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  36.93 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.6 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  28.92 
 
 		 459 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.91 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  31.68 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  31.19 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  31.78 
 
 		 437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  32.59 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  32.6 
 
 		 459 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  31.3 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  33.84 
 
 		 438 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  32.99 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  33.01 
 
 		 421 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  32.17 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.9 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  30.97 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  32.26 
 
 		 470 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  31.7 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.54 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  33.74 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  31.24 
 
 		 421 aa  159  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  33.16 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  35.91 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  31.31 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>