More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0918 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  56.47 
 
 
256 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  56.86 
 
 
256 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  56.86 
 
 
256 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  55.12 
 
 
256 aa  267  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  51.57 
 
 
252 aa  244  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  53.94 
 
 
255 aa  242  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  49.22 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  46.3 
 
 
261 aa  200  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  44.06 
 
 
264 aa  198  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  41.41 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  41.96 
 
 
257 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  41.5 
 
 
255 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  40.57 
 
 
258 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  44.35 
 
 
264 aa  185  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  39.92 
 
 
255 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 
259 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  40.93 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  38.52 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  36.05 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  39 
 
 
254 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  39.22 
 
 
280 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  39 
 
 
254 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  39.15 
 
 
259 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 
263 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  38.85 
 
 
260 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  45.06 
 
 
267 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  38.76 
 
 
259 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  38.61 
 
 
254 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  38.61 
 
 
254 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  38.61 
 
 
254 aa  168  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  38.61 
 
 
254 aa  168  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  38.61 
 
 
254 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
252 aa  168  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  38.61 
 
 
254 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 
260 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  38.22 
 
 
254 aa  165  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  38.19 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  39.27 
 
 
265 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  35.8 
 
 
253 aa  163  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  38.76 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  39.45 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  38.76 
 
 
256 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  38.76 
 
 
256 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  38.76 
 
 
256 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 
257 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 
258 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 
258 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  38.37 
 
 
256 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 
266 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  38.76 
 
 
255 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  39.52 
 
 
264 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  38.76 
 
 
255 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  38.76 
 
 
255 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  40.39 
 
 
265 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  37.98 
 
 
258 aa  158  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
255 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 
254 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  37.17 
 
 
227 aa  155  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 
258 aa  155  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 
268 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  35.77 
 
 
260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  36.12 
 
 
230 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  39.68 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  38.13 
 
 
271 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  38.87 
 
 
268 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  37.24 
 
 
262 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  34.62 
 
 
235 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  35.8 
 
 
257 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.55 
 
 
277 aa  145  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
281 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  31.3 
 
 
261 aa  142  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.74 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  34.85 
 
 
295 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
226 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  37.86 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  34.36 
 
 
356 aa  126  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  30.26 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  28.24 
 
 
306 aa  95.5  7e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
300 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  32.74 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
282 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
289 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>