More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0895 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  100 
 
 		 275 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  66.16 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  64.86 
 
 		 278 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  59.07 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  63.77 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  53.91 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  55 
 
 		 274 aa  245  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  47.6 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  46.79 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.57 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  46.07 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  48.31 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.91 
 
 		 285 aa  188  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  48.47 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  48.47 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.57 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.09 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  45.86 
 
 		 292 aa  185  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.51 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  45 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.43 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.88 
 
 		 275 aa  181  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.34 
 
 		 279 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  47.19 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  43.28 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.8 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  45.56 
 
 		 275 aa  179  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.84 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  44.89 
 
 		 317 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  47.57 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  42.42 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  44.28 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  46.13 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.37 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  44.28 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.21 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  45.39 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.88 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  47.69 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  43.07 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  43.07 
 
 		 274 aa  171  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.52 
 
 		 283 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  43.18 
 
 		 284 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.35 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.79 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  41.96 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  40.22 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  47.19 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  47.19 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  46.82 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  46.82 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  46.82 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  46.82 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  45.2 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  44.18 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  46.82 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  47.04 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  44.53 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  41.34 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  46.96 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  41.54 
 
 		 285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  41.96 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  44.57 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  45.06 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  38.78 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  43.63 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  45 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.53 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  43.37 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  38.87 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.07 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  40.86 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  46.3 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  38.75 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  45 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  43.7 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  47.98 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  40.74 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  41.86 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  37.59 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  46.89 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.29 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  43.31 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  39.86 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  43.24 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  40.66 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.65 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  42.55 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  36.39 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  37.64 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  35.92 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.85 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  47.51 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  39.92 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  39.24 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  35.74 
 
 		 361 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  42.75 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  33.58 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  38.83 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>