More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0827 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  56.87 
 
 		 907 aa  913    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  50.11 
 
 		 873 aa  694    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  73.05 
 
 		 880 aa  1230    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  44.14 
 
 		 820 aa  711    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  58.6 
 
 		 910 aa  952    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  52.38 
 
 		 919 aa  823    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  69.37 
 
 		 877 aa  1157    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  57.45 
 
 		 883 aa  926    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  44.1 
 
 		 804 aa  731    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  51.71 
 
 		 904 aa  763    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  55.13 
 
 		 910 aa  889    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  56.73 
 
 		 888 aa  907    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  55.29 
 
 		 916 aa  818    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  73.17 
 
 		 875 aa  1233    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  57.55 
 
 		 908 aa  912    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  57 
 
 		 880 aa  906    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.15 
 
 		 872 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  55.15 
 
 		 905 aa  783    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  57.59 
 
 		 910 aa  939    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  74.91 
 
 		 876 aa  1238    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  44.61 
 
 		 868 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  57.4 
 
 		 929 aa  884    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  57.67 
 
 		 915 aa  888    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  57.77 
 
 		 911 aa  912    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  50.69 
 
 		 858 aa  765    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  44.03 
 
 		 804 aa  724    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  67.88 
 
 		 877 aa  1136    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  56.26 
 
 		 882 aa  919    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  54.43 
 
 		 925 aa  806    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  58.92 
 
 		 908 aa  931    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  57.28 
 
 		 923 aa  908    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  56.09 
 
 		 907 aa  922    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  54.51 
 
 		 962 aa  794    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  67.47 
 
 		 879 aa  1142    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  51.84 
 
 		 864 aa  778    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  57.73 
 
 		 881 aa  906    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  55.25 
 
 		 916 aa  812    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  57.29 
 
 		 921 aa  876    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  53.83 
 
 		 897 aa  828    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  55.84 
 
 		 929 aa  796    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 878 aa  1745    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  51.18 
 
 		 914 aa  859    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  58.98 
 
 		 898 aa  954    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  52.58 
 
 		 904 aa  799    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  55.54 
 
 		 896 aa  823    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  46.95 
 
 		 882 aa  633  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 		 932 aa  630  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 		 871 aa  625  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 		 815 aa  628  1e-178  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 		 869 aa  624  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  41.62 
 
 		 870 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  43.59 
 
 		 891 aa  619  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.23 
 
 		 873 aa  622  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  41.89 
 
 		 851 aa  618  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 		 872 aa  618  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  42.19 
 
 		 854 aa  614  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 869 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 		 863 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  43.98 
 
 		 859 aa  615  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  41.97 
 
 		 854 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  42.43 
 
 		 852 aa  609  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  44.95 
 
 		 862 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 854 aa  608  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  40.61 
 
 		 870 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.84 
 
 		 863 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 		 881 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 		 862 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 882 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  37.84 
 
 		 870 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 861 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.47 
 
 		 872 aa  601  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 		 859 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  43.62 
 
 		 878 aa  601  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.38 
 
 		 859 aa  599  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  41.4 
 
 		 938 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 851 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 851 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 		 854 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  41.37 
 
 		 856 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  41.34 
 
 		 855 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 		 860 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 		 880 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  41.34 
 
 		 855 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 		 874 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  39.5 
 
 		 855 aa  593  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.31 
 
 		 887 aa  593  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 		 871 aa  593  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 		 853 aa  593  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 851 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 856 aa  595  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 		 861 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.57 
 
 		 853 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  37 
 
 		 867 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  41.12 
 
 		 855 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 856 aa  592  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 939 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 		 861 aa  591  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  41.19 
 
 		 896 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 939 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 939 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>