More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0746 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0746  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 124 aa  228  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00478946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2543  50S ribosomal protein L7/L12  89.52 
 
 		 124 aa  183  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0567  50S ribosomal protein L7/L12  86.18 
 
 		 124 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0352  50S ribosomal protein L7/L12  87.2 
 
 		 125 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1700  50S ribosomal protein L7/L12  87.2 
 
 		 125 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0338  50S ribosomal protein L7/L12  87.2 
 
 		 125 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  78.57 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0233  50S ribosomal protein L7/L12  80.65 
 
 		 125 aa  148  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1421  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 		 125 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927716  normal  0.299454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1397  50S ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0639  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.500427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0425  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2675  ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000113086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  63.2 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1942  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.542016  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1175  50S ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000154127  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  53.08 
 
 		 130 aa  103  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3450  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0256667  normal  0.0368357 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_002950  PG0393  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4478  ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  46.67 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0848  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00030  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  78.87 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  52.17 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  52.03 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  55 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  72.6 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  52.1 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0172  50S ribosomal protein L7/L12  75 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  51.26 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  51.26 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  58.12 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  57.39 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  59.29 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0030  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0666406  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  57.39 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2197  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000379347  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2107  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000324258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  59.29 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 128 aa  90.9  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  69.44 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  52.1 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  58.12 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  61.06 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>