225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0520 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0520  GDSL family lipase  100 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  47.6 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  47.6 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  46.45 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  46.43 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.85 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.71 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  44.93 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  41 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  41.15 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.24 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.2 
 
 		 227 aa  117  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  36.41 
 
 		 226 aa  117  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  40 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  36.71 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  35.68 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  38.27 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  37.76 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  39.79 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  37.76 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  34.98 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  39.49 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.2 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  37.82 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  38.02 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  38.14 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  34.74 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  36.22 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  34.33 
 
 		 226 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1888  GDSL family lipase  33.88 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172385  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  37.31 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  34.78 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  37.84 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  36.61 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  36.61 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  35.96 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.32 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  36.62 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  36.32 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  33.5 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  37.1 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  34.01 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  32.06 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  37.97 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  31.61 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1901  GDSL family lipase  39.77 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0627412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  36.04 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2205  Arylesterase  36.07 
 
 		 185 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  30.29 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3031  arylesterase  34.55 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  34.24 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  33.68 
 
 		 223 aa  99.8  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  36.13 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1242  GDSL family lipase  38.69 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  normal  0.178592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  32.49 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  34.24 
 
 		 182 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  35.14 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  35.57 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  33.66 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  34.22 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  32.49 
 
 		 201 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  33.5 
 
 		 201 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  33.88 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  32.79 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  36.45 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  33.17 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  34.22 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  33.67 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  34.36 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  33.33 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  33.96 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  32.49 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  33.33 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  33.5 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  34.05 
 
 		 184 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  31.98 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  32.24 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  34.87 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  33.69 
 
 		 232 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  33.68 
 
 		 219 aa  95.1  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  32.07 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  33.69 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  33.69 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  33.69 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  33.69 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  33.69 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  33.16 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  35.15 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  29.35 
 
 		 255 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  33.16 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  34.05 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.97 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  31.09 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  31.89 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  32.07 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  34.01 
 
 		 188 aa  91.7  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2424  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.11 
 
 		 178 aa  91.7  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  31 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  32.43 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>