149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0433 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 340 aa  690    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  58.64 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  58.02 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  58.02 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  55.86 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  57.28 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  56.37 
 
 		 329 aa  364  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  39.88 
 
 		 365 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  40.13 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  39.88 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  38.67 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  39.88 
 
 		 357 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  35.51 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  33.12 
 
 		 343 aa  208  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  37.24 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  36.64 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  36.94 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  36.94 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  35.74 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  36.64 
 
 		 384 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  35.84 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  32.82 
 
 		 354 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  34.48 
 
 		 352 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  36.34 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  33.93 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  32.82 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  36.58 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  36.58 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  36.58 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  36.58 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  36.26 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  36.34 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  36.58 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  36.28 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  37.11 
 
 		 374 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  36.45 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  35.84 
 
 		 359 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.42 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 		 357 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 		 356 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  33.63 
 
 		 359 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  35.56 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  31.58 
 
 		 394 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  32.93 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  32.92 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  33.03 
 
 		 362 aa  179  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  35.4 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  34.04 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  32.82 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 369 aa  165  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 363 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  31.89 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  30.46 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  29.22 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  26.81 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  31.78 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 324 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 		 331 aa  99.8  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  29.56 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 322 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  26.54 
 
 		 862 aa  89.4  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  27.9 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  27.51 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  22.7 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  27.02 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  24.1 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  24.1 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  21.74 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  27.92 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  20.25 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  23.21 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  23.51 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  23.8 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  23.19 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  23.21 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  23.21 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  24.82 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>