144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0360 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 445 aa  910    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  99.33 
 
 		 445 aa  905    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  55.24 
 
 		 416 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  55.24 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  42.96 
 
 		 431 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  42.28 
 
 		 444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  40.4 
 
 		 401 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  39.76 
 
 		 416 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  37.47 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  39.42 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  37.44 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  36.71 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  38.46 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  38.21 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  34.31 
 
 		 429 aa  226  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  33.96 
 
 		 445 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  32.16 
 
 		 414 aa  179  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  32.16 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  31.91 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  32.35 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  31.64 
 
 		 384 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  29.73 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  29.73 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  33.68 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  28.83 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  28.97 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  28.72 
 
 		 413 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  28.72 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  27.69 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  27.69 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  27.69 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  28.8 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  30.49 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  28.35 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  28.92 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  26.1 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  25.98 
 
 		 390 aa  136  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  26.51 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  28.53 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  28.57 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  25.81 
 
 		 524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  28.31 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  29.4 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  28.72 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  28.04 
 
 		 423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  29.38 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  25.14 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  26.83 
 
 		 417 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  25.99 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  29.02 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  28.7 
 
 		 542 aa  106  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  26.56 
 
 		 544 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  23.18 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  23.18 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  33.18 
 
 		 225 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  25.37 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  26.25 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  27 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  25.4 
 
 		 393 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  25.67 
 
 		 859 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  25.67 
 
 		 833 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  25.67 
 
 		 833 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  24.29 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  23.25 
 
 		 392 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  23.19 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  26.3 
 
 		 420 aa  93.2  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  25.2 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  23.67 
 
 		 428 aa  92.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  27.45 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  25.81 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  24.57 
 
 		 447 aa  91.3  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  24.14 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  21.99 
 
 		 436 aa  90.5  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  22.83 
 
 		 413 aa  90.1  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  24.58 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  23.06 
 
 		 413 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  25.65 
 
 		 416 aa  86.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  21.88 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  22.77 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  29.02 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  22.22 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  23.37 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  23.87 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  26.69 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  23.19 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  23.1 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  23.76 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  25.7 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  23.98 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  22.75 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  25.48 
 
 		 397 aa  79.7  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  24.55 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  21.89 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  26.33 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  26.33 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  23.9 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  24.35 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  26.12 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  24.54 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  24.35 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>