32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0319 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0319  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  785    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5377  hypothetical protein  64.13 
 
 		 410 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0496  hypothetical protein  64.09 
 
 		 410 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5852  hypothetical protein  62.87 
 
 		 425 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0575384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0536  hypothetical protein  64.91 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131848  decreased coverage  0.00419582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5193  hypothetical protein  58 
 
 		 412 aa  405  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.249883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  53.77 
 
 		 414 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19210  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  52.59 
 
 		 427 aa  391  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3559  hypothetical protein  52.94 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00410  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  51.72 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0028  permease (transport protein)  52.13 
 
 		 395 aa  368  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1097  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  49.05 
 
 		 395 aa  349  4e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2227  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  50.27 
 
 		 394 aa  328  7e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0711  transmembrane transport protein  46.62 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  46.58 
 
 		 413 aa  316  5e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4281  putative transmembrane transport protein  47.53 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3381  manganese transporter NRAMP  45.03 
 
 		 408 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.764333 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0987  manganese transporter NRAMP  45.33 
 
 		 410 aa  290  4e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0438146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  48.98 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  48.98 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  51.03 
 
 		 414 aa  270  4e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000480  hypothetical protein  38.18 
 
 		 412 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3271  manganese transporter NRAMP  38.21 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.14 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  25.47 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  27.69 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  24.87 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  26.21 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  23.75 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  24.66 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.4 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  24.65 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>