More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0297 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  503  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  64.29 
 
 		 252 aa  338  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  63.75 
 
 		 252 aa  335  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  62.95 
 
 		 252 aa  335  5.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3800  ABC transporter related  62.55 
 
 		 252 aa  330  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2401  ABC transporter related  63.75 
 
 		 252 aa  321  8e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0997446  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  62.3 
 
 		 252 aa  317  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1766  ABC transporter related  57.77 
 
 		 252 aa  315  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0708561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2038  ABC transporter related protein  57.37 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4147  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  56.57 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.045067  normal  0.0104969 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0068  ABC transporter related  56.57 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  59.6 
 
 		 253 aa  311  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4095  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  56.18 
 
 		 252 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5025  ABC transporter related protein  61.75 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1396  ABC transporter related protein  60.32 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471533  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2369  ABC transporter related  57.77 
 
 		 252 aa  304  9.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.068232 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1114  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1008  ABC transporter related  57.14 
 
 		 252 aa  298  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  49.6 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04610  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  57.77 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2666  ABC transporter related protein  56.57 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25320  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  53.39 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1353  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3705  ABC transporter related  55.38 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252984  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1543  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 259 aa  278  6e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000329  ferric vibriobactin enterobactin transport system ATP-binding protein  48.61 
 
 		 251 aa  278  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000365879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0733  ABC transporter related  49.4 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16570  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  53.75 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06132  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  49.4 
 
 		 253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  49.4 
 
 		 253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0998  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 		 254 aa  271  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000010903  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1008  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5223  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.64 
 
 		 250 aa  262  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30510  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  51.95 
 
 		 254 aa  261  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0010  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 		 250 aa  261  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2913  ABC transporter related  52.3 
 
 		 250 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4915  ABC transporter related  50.63 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5244  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 250 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5231  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  50.63 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4267  hypothetical protein  54.18 
 
 		 252 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4949  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.957601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4792  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.153192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5194  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4812  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5327  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.502609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2660  ABC transporter related  50.41 
 
 		 250 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3667  ABC transporter related  55.23 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3341  ABC transporter related  51.98 
 
 		 260 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000683738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3468  ABC transporter related  51.98 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3961  ABC transporter related  53.78 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3222  ABC ferric siderophore transporter, ATPase subunit  53.39 
 
 		 252 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0637  ABC transporter related  44.4 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1627  ABC transporter related  50.63 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2624  ABC transporter related  51 
 
 		 252 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1026  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  49.6 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0106643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4399  ABC transporter related  51.41 
 
 		 252 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2592  ferric siderophore ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1929  ABC transporter related  46.61 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.284313  normal  0.0400988 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0658  ABC transporter related  45.49 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1910  ABC transporter related  44.86 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.115927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  46.67 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  42.51 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  44.81 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  45.45 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  45.45 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  42.74 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1392  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 264 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00709289  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  48.18 
 
 		 265 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  42.86 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  43.29 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 273 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  40 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 273 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 273 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  42.35 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 273 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  40 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  41.08 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  42.32 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  43.81 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  43.23 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  39.66 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 		 260 aa  188  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 265 aa  188  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.2 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  38.43 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>