More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0278 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  872    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  39.08 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  39.16 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 457 aa  295  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 453 aa  292  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 452 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  38.26 
 
 		 452 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 452 aa  278  9e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  36.05 
 
 		 464 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  38.61 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 469 aa  259  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  37.71 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  37.71 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  37.71 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  37.71 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  37.71 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  37.71 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  37.71 
 
 		 445 aa  257  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  35.88 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  35.63 
 
 		 480 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  36.68 
 
 		 445 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  39.63 
 
 		 468 aa  249  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  35.76 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  33.96 
 
 		 443 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  33.96 
 
 		 443 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  33.96 
 
 		 443 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 443 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  33.96 
 
 		 443 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 443 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  33.96 
 
 		 443 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  33.73 
 
 		 443 aa  229  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  35.03 
 
 		 458 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  32.09 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  33.02 
 
 		 468 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  33.02 
 
 		 468 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  33.02 
 
 		 468 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  33.02 
 
 		 468 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 443 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  33.02 
 
 		 468 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  33.56 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  33.49 
 
 		 442 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.35 
 
 		 476 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  27.03 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.01 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  28.42 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  28.57 
 
 		 459 aa  140  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.87 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 451 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 474 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  26.87 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  26.38 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  26.82 
 
 		 476 aa  133  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  28.31 
 
 		 477 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 481 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 473 aa  126  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.61 
 
 		 478 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 456 aa  123  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.61 
 
 		 478 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.61 
 
 		 478 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.61 
 
 		 478 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.35 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.35 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.61 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  26.42 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  27.15 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  27.63 
 
 		 469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 456 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  26.87 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 427 aa  120  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  27.83 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  27.57 
 
 		 458 aa  119  9e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  30.56 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  27.15 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  25.82 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 450 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  24.77 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  24.35 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  23.68 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>