126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0162 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  44.39 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  30.94 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  32.16 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  27.8 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  30.04 
 
 		 256 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 		 282 aa  91.7  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  31.22 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  26.32 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  27.27 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  29.74 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  28.09 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  26.78 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  26.92 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  25.76 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  27.78 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  28.88 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  27.97 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  27.43 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  27.43 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  25.74 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  27.43 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  23.85 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  23.85 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  25.63 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  24.66 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  25.65 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  24.2 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  27.23 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  27.47 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  28.28 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  28.4 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  28.4 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  25.54 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  26.92 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  27.46 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  25.11 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  33.67 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  33.67 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  25.66 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  27.05 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  26.61 
 
 		 249 aa  62  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  34.69 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  25.66 
 
 		 292 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  37.36 
 
 		 266 aa  62  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  28.33 
 
 		 378 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  33.67 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  33.67 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  33.67 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  33.67 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  33.67 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  34.48 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  25.31 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  25.21 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  27.47 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  36.78 
 
 		 864 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  27.91 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  27.42 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  27.91 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  27.91 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  27.91 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  27.9 
 
 		 378 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  26.11 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  29.17 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  30.93 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  27.05 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  27.06 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  27.69 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  27.69 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  27.69 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  25.23 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  30.89 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  30.28 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  30.28 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  24.89 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  26.16 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  31.71 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  21.37 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  27.31 
 
 		 276 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  25.21 
 
 		 291 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  27.19 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  34.74 
 
 		 497 aa  52  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  27.19 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  27.19 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  27.19 
 
 		 274 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  27.19 
 
 		 274 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  28.37 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  24.37 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  32.29 
 
 		 491 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  28.57 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  29.55 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  28.76 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  31.25 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  24.46 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  29.35 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>