40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0096 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0096  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0075  hypothetical protein  66.3 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  42.71 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  37.36 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  36.26 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  34.78 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  36.26 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  39.33 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  35.16 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  39.53 
 
 		 93 aa  67  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  32.61 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  43.06 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  32.22 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  36.96 
 
 		 377 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  33.72 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  29.21 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  30.38 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4180  acetyltransferase-like protein  32.14 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  29.63 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  28.05 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  25.27 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  29.69 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  25.27 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  35.59 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  26.37 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  39.62 
 
 		 112 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0293  acetyltransferase-like protein  30.77 
 
 		 111 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  28.05 
 
 		 100 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  33.96 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  27.47 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  29.03 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  32.2 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  30.36 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  27.38 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  32.73 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0044  hypothetical protein  25.32 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209264  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0054  hypothetical protein  25.32 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.064515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0063  hypothetical protein  25.32 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777718  normal  0.024281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>