More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0095 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  68.51 
 
 		 194 aa  254  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  56.5 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  53.59 
 
 		 184 aa  197  7.999999999999999e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  53.3 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  56.98 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  57.67 
 
 		 281 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  58.76 
 
 		 195 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  58.1 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  53.33 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  53.04 
 
 		 194 aa  181  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  53.33 
 
 		 184 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6610  resolvase domain-containing protein  54.24 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.874577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  51.06 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  49.73 
 
 		 182 aa  177  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1218  putative invertase  57.06 
 
 		 183 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  49.46 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  53.59 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  46.32 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  51.38 
 
 		 188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  53.04 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  48.62 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  50.84 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  51.38 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  51.4 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  50.28 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  49.72 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  48.89 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  50.83 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  50.83 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  48.13 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  48.66 
 
 		 188 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  49.72 
 
 		 190 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  49.72 
 
 		 187 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  50.56 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  47.85 
 
 		 192 aa  164  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  53.9 
 
 		 197 aa  164  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  47.19 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  47.31 
 
 		 309 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  45.25 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  49.71 
 
 		 191 aa  160  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  49.17 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  49.71 
 
 		 191 aa  160  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  42.86 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  48.04 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  47.57 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  47.57 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 196 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  57.34 
 
 		 209 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  49.15 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  46.93 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  43.65 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  43.65 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  52.57 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  45.11 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  45.36 
 
 		 196 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  44.13 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  47.62 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  44.86 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  46.77 
 
 		 184 aa  148  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  45.99 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  43.68 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  40.66 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  45.11 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  45.2 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  42.63 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  44.92 
 
 		 307 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  44.92 
 
 		 307 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  44.81 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  47.54 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  41.21 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  47.2 
 
 		 176 aa  141  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  46.99 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  49.17 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  45.41 
 
 		 184 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  44.13 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  41.44 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  48.7 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  38.59 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  46.77 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0696  resolvase-like protein  46.77 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  46.28 
 
 		 215 aa  134  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  43.62 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  44.28 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  39.79 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  44.79 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  39.79 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  45.21 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  44.28 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  38.86 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>