20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0089 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0089  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  915    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0146  hypothetical protein  43.05 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1966  hypothetical protein  40.32 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0639  hypothetical protein  41.79 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1684  hypothetical protein  41.59 
 
 		 430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0162  hypothetical protein  40.89 
 
 		 429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00501081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0799  hypothetical protein  42.21 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0295702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1300  hypothetical protein  37.67 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4986  hypothetical protein  39.41 
 
 		 450 aa  286  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3931  hypothetical protein  42.13 
 
 		 482 aa  285  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1050  hypothetical protein  38.07 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3388  hypothetical protein  38.05 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0380  hypothetical protein  40 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0436  hypothetical protein  40 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.281962  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0427  hypothetical protein  41.44 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1487  hypothetical protein  41.38 
 
 		 438 aa  272  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1312  hypothetical protein  51.36 
 
 		 252 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.426965  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0137  aminopeptidase domain-containing protein  29 
 
 		 412 aa  193  5e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000072892 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13451  hypothetical protein  27.97 
 
 		 434 aa  163  7e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1313  hypothetical protein  29.58 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>