49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0088 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3551  flagellin modification protein FlmD  100 
 
 		 348 aa  689    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288213  normal  0.478798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0088  flagellin modification protein FlmD  100 
 
 		 348 aa  689    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0775  GCN5-related N-acetyltransferase  29.77 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.736267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3708  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 		 491 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2325  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 399 aa  97.1  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1777  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  28.74 
 
 		 353 aa  96.3  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 500 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1246  surface polysaccharide biosynthesis protein, transferase  28.73 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0585  Glycosyltransferase 28 domain protein  29.31 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0212  glycosyltransferase  27.27 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1722  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  24.58 
 
 		 366 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.000000995327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2095  putative flagellin modification protein FlmD  23.28 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4299  flagellin modification protein FlmD  31.43 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2760  polysaccharide biosynthesis protein; glycosyltransferase  26.76 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1967  flagellin modification protein FlmD  29.48 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.979737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4265  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  25.75 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.514785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2222  glycosyltransferase 28-like protein  25.28 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3029  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  25.65 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0657  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.140492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3096  GCN5-related N-acetyltransferase  28.64 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3075  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  26.95 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2211  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  30.54 
 
 		 543 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2626  FlaR protein (FlaR)  24.72 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3209  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  27.65 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2633  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  30.84 
 
 		 544 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1136  polysaccharide biosynthesis protein, glycosyltransferase  26.22 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  24.53 
 
 		 525 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0414  putative glycosyltransferase spore coat polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407624  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1892  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  28.97 
 
 		 652 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  31.41 
 
 		 611 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2427  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  25.7 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.506517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3563  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  25.34 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  0.902777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1331  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  27.18 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.45 
 
 		 548 aa  60.1  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1283  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  23.71 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.44 
 
 		 593 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0402  putative flagellar protein  23.4 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.537873  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3944  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  21.23 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13692  normal  0.0702368 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1507  flagellar protein, putative  23.19 
 
 		 274 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1329  flagellar protein, putative  23.19 
 
 		 274 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1321  nucleotidase specific for PseC product, UDP-4-amino-4,6-dideoxy-beta-L-AltNAc  22.5 
 
 		 274 aa  49.7  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165728  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3115  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  23.71 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0645  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  36.84 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3728  putative spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  30.72 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.9 
 
 		 611 aa  46.2  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1197  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  30.77 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01590  spore coat polysaccharide biosynthesis protein, predicted glycosyltransferase  25.64 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0482477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1970  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  24.49 
 
 		 312 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.750902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>