49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0075 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0075  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0096  hypothetical protein  66.3 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  42.11 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  40.45 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  40.74 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  37.36 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  35.16 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  32.61 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  33.7 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  34.07 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  41.33 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  34.07 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  32.22 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  33.68 
 
 		 377 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  30.86 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5642  hypothetical protein  29.49 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4595  hypothetical protein  29.49 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03959  hypothetical protein  29.49 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3900  hypothetical protein  29.49 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4681  hypothetical protein  29.49 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4368  hypothetical protein  29.49 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.337013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3865  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03998  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  29.49 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0293  acetyltransferase-like protein  28.4 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3304  hypothetical protein  28.21 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  35.59 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  33.96 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  26.83 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  30.49 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4180  acetyltransferase-like protein  27.69 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  29.79 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0995  acetyltransferase  32.2 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  26.51 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  38.64 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03910  predicted acetyltransferase  35.09 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  35.85 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  37.14 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  34.55 
 
 		 99 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  30.36 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  34.55 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  28.57 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  35.56 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1014  hypothetical protein  28.81 
 
 		 117 aa  40  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.411227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  30.36 
 
 		 111 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3734  hypothetical protein  30.36 
 
 		 111 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0465145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>