23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0025 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  376  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  57.25 
 
 
164 aa  162  2e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  54.35 
 
 
163 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  54.35 
 
 
163 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  47.62 
 
 
161 aa  134  6e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  40.23 
 
 
169 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  39.16 
 
 
171 aa  110  1e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  34.84 
 
 
174 aa  83.2  2e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  51.32 
 
 
163 aa  81.6  6e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  35.77 
 
 
166 aa  80.1  2e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  34.73 
 
 
176 aa  78.2  6e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  34.97 
 
 
170 aa  74.7  7e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  42.7 
 
 
161 aa  72.8  3e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  53.23 
 
 
170 aa  69.7  2e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  53.23 
 
 
170 aa  69.7  2e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  29.67 
 
 
175 aa  65.9  3e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  31.33 
 
 
189 aa  62.8  2e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  35.71 
 
 
191 aa  62.4  4e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  29.91 
 
 
177 aa  58.2  6e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  32.84 
 
 
198 aa  56.2  2e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  28.21 
 
 
177 aa  55.5  4e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  28.21 
 
 
177 aa  55.5  5e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6516  hypothetical protein  54.76 
 
 
58 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.131364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>