188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0019 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  100 
 
 		 279 aa  582  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3448  carboxylesterase  68.35 
 
 		 281 aa  415  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0852  S-formylglutathione hydrolase  68.86 
 
 		 276 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397354  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2511  carboxylesterase  68.86 
 
 		 276 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.863748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3123  carboxylesterase  67.03 
 
 		 276 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0052  carboxylesterase  68.5 
 
 		 277 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0474  S-formylglutathione hydrolase  66.3 
 
 		 275 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3945  S-formylglutathione hydrolase  64.47 
 
 		 276 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  58.72 
 
 		 292 aa  346  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  53.79 
 
 		 278 aa  315  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  54.8 
 
 		 285 aa  315  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  57.5 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5942  S-formylglutathione hydrolase  53.9 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  53.96 
 
 		 279 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  56.16 
 
 		 283 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  54.68 
 
 		 279 aa  310  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2452  S-formylglutathione hydrolase  54.29 
 
 		 279 aa  310  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243797  normal  0.206976 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  54.45 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  55.07 
 
 		 283 aa  308  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  54.48 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0141  S-formylglutathione hydrolase  52.16 
 
 		 293 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0333539  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 		 276 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  53.41 
 
 		 279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  53.93 
 
 		 280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  54.12 
 
 		 285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  50.72 
 
 		 279 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1021  S-formylglutathione hydrolase  53.99 
 
 		 277 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  53.05 
 
 		 279 aa  298  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5934  carboxylesterase  54.68 
 
 		 282 aa  298  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.304704  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  51.97 
 
 		 289 aa  298  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  51.25 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  51.97 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4919  S-formylglutathione hydrolase  50.72 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1834  carboxylesterase  53.9 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.018763  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  51.45 
 
 		 279 aa  296  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2627  S-formylglutathione hydrolase  53.96 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  51.08 
 
 		 280 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  54.61 
 
 		 280 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  54.12 
 
 		 280 aa  295  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  51.47 
 
 		 278 aa  295  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2651  carboxylesterase  53.24 
 
 		 282 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2524  S-formylglutathione hydrolase  53.24 
 
 		 282 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225567  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  51.09 
 
 		 279 aa  294  8e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1993  carboxylesterase  53.96 
 
 		 282 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  51.09 
 
 		 279 aa  294  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2603  carboxylesterase  53.96 
 
 		 282 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1026  S-formylglutathione hydrolase  53 
 
 		 286 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199417  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0863  S-formylglutathione hydrolase  53 
 
 		 286 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0867  S-formylglutathione hydrolase  53 
 
 		 286 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  51.09 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0694  S-formylglutathione hydrolase  53.24 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.816955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3999  carboxylesterase  54.04 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  52.57 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4831  S-formylglutathione hydrolase  51.45 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.256219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  54.8 
 
 		 282 aa  292  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2291  S-formylglutathione hydrolase  52.6 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  50.72 
 
 		 280 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  53.41 
 
 		 280 aa  292  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0325  esterase, putative  52.65 
 
 		 286 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0623  putative esterase  52.65 
 
 		 286 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.778268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2457  putative esterase  52.65 
 
 		 286 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  50.72 
 
 		 280 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0071  putative esterase  52.65 
 
 		 286 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  50.72 
 
 		 280 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2510  S-formylglutathione hydrolase  50.18 
 
 		 273 aa  292  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  53.05 
 
 		 281 aa  291  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2801  carboxylesterase  52.25 
 
 		 294 aa  291  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.234504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3515  S-formylglutathione hydrolase  53.62 
 
 		 278 aa  291  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  50.36 
 
 		 280 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  50.72 
 
 		 280 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3531  carboxylesterase  50.18 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419783 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  51.77 
 
 		 279 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  51.96 
 
 		 285 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  53.43 
 
 		 281 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_004310  BR0127  esterase, putative  55.42 
 
 		 251 aa  288  6e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  52.19 
 
 		 276 aa  288  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  52.54 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  51.94 
 
 		 280 aa  287  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 		 280 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  51.43 
 
 		 281 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  51.6 
 
 		 281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1116  S-formylglutathione hydrolase  50.36 
 
 		 283 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.85145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1087  S-formylglutathione hydrolase  50.36 
 
 		 283 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  54.12 
 
 		 285 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0122  S-formylglutathione hydrolase  55.02 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  53.6 
 
 		 289 aa  285  7e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02083  predicted esterase  54.87 
 
 		 278 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1504  S-formylglutathione hydrolase  54.87 
 
 		 278 aa  285  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0638079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0812  S-formylglutathione hydrolase  54.87 
 
 		 278 aa  285  8e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.631287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02042  hypothetical protein  54.87 
 
 		 278 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1494  S-formylglutathione hydrolase  54.87 
 
 		 278 aa  285  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2288  S-formylglutathione hydrolase  54.87 
 
 		 278 aa  285  8e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0122  carboxylesterase  52.5 
 
 		 288 aa  284  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  53.76 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 		 280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  53.58 
 
 		 276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3289  S-formylglutathione hydrolase  54.87 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.795091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  53.76 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  53.76 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2413  S-formylglutathione hydrolase  52.14 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>