More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0007 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  100 
 
 		 292 aa  587  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  66.1 
 
 		 301 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  66.21 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  65.99 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  60.4 
 
 		 299 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  60 
 
 		 299 aa  348  5e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  55.78 
 
 		 301 aa  326  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  52.41 
 
 		 297 aa  289  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  51.04 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  49.83 
 
 		 288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  48.6 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  48.6 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  50.68 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  48.25 
 
 		 293 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  49 
 
 		 319 aa  261  8e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  48.11 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  47.62 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  49.35 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  51.71 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  47.62 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  50.77 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  50.17 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  50.67 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  46.1 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  44.1 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  44.59 
 
 		 303 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  45.74 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  46.18 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  49.49 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  43.42 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  45.04 
 
 		 294 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  47.2 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  45.6 
 
 		 315 aa  237  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  45 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  42.51 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  45.14 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  43.48 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  45.87 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  45.61 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  42.46 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  45.1 
 
 		 296 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  43.11 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  42.09 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  42.27 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  43.99 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  46.05 
 
 		 306 aa  215  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  41.39 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  43.6 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  43.6 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  42.12 
 
 		 323 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  39.07 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  40.91 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  43.64 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  43.64 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  42.67 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  43.64 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  43.64 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  43.64 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  43.64 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  43.64 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  37.99 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  43.3 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  38.73 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  43.1 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  42.47 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  41.5 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  39.52 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  39.32 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  39.08 
 
 		 272 aa  205  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  43.1 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  42.96 
 
 		 305 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  42.96 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.46 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  42.96 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  44.48 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  43.1 
 
 		 307 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  41.44 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  40.48 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  40.48 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  40.48 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  42.96 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  40.48 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  41.26 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  41.24 
 
 		 294 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  44.06 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  39.93 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  39.37 
 
 		 282 aa  201  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  42.41 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  40.14 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  43.16 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  45.33 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  45.96 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  42.21 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  41.5 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  42.11 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  40.14 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  39.79 
 
 		 278 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  40.21 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  43.86 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  39.25 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>