69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2487 on replicon NC_007968
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  660    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  28.44 
 
 
976 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  37.74 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  40 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  44.12 
 
 
445 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  29.22 
 
 
444 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  41.11 
 
 
440 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  40 
 
 
457 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  39.44 
 
 
451 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  31.03 
 
 
455 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  23.56 
 
 
368 aa  59.7  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  38.55 
 
 
446 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  40 
 
 
532 aa  59.7  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  37.5 
 
 
443 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  36.11 
 
 
448 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  29.09 
 
 
457 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  28.89 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  44.78 
 
 
176 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  22 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  40.26 
 
 
461 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  35.44 
 
 
450 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  35.71 
 
 
228 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  31 
 
 
461 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  28.7 
 
 
482 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  22.91 
 
 
410 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  40.98 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  19.94 
 
 
455 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  24.44 
 
 
449 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0976  ABC transporter related  27.22 
 
 
225 aa  50.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.136497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  33.77 
 
 
430 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  25 
 
 
452 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  38.24 
 
 
458 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  33.77 
 
 
452 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  27.4 
 
 
464 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  35.05 
 
 
431 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  32 
 
 
533 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  31.03 
 
 
256 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  36.07 
 
 
352 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  20.96 
 
 
464 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  40.74 
 
 
708 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0057  ABC transporter related  26.35 
 
 
217 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268272  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2378  ABC transporter, ATP-binding protein  45.65 
 
 
229 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.514207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  33.33 
 
 
619 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  28.97 
 
 
440 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  41.86 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  37.93 
 
 
641 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  29.55 
 
 
410 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  34.41 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  38.36 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  41.86 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 
556 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  29.76 
 
 
403 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.81 
 
 
243 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.744686  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.61 
 
 
548 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  36.36 
 
 
597 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  32.84 
 
 
584 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  25.69 
 
 
513 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  36.23 
 
 
251 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  32.53 
 
 
582 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  29.55 
 
 
271 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  35.71 
 
 
591 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  34.25 
 
 
601 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  29.73 
 
 
588 aa  43.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  28.24 
 
 
421 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  20.51 
 
 
382 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  34.94 
 
 
225 aa  42.7  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  34.85 
 
 
670 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 
495 aa  42.4  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>