More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2422 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2422  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 572 aa  1159    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0102  MscS mechanosensitive ion channel  56.89 
 
 		 537 aa  609  1e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.102568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0293  MscS mechanosensitive ion channel  42.51 
 
 		 447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  41.06 
 
 		 439 aa  276  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  30.79 
 
 		 445 aa  213  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5986  MscS Mechanosensitive ion channel  38.18 
 
 		 337 aa  193  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  30.46 
 
 		 474 aa  170  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 489 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0743  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 460 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  29.56 
 
 		 459 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 311 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  32.05 
 
 		 349 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  25.58 
 
 		 334 aa  132  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  31.91 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02489  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  33.2 
 
 		 367 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 		 384 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 		 295 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 330 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  30.33 
 
 		 307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  29.54 
 
 		 331 aa  113  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 336 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 429 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 290 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 276 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 287 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 262 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  31.43 
 
 		 283 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 301 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 304 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 288 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 291 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  25.27 
 
 		 296 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 274 aa  101  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 280 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 544 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  29.9 
 
 		 279 aa  100  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  29.88 
 
 		 298 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 		 360 aa  99.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  26.51 
 
 		 356 aa  99  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  29.1 
 
 		 284 aa  99.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 400 aa  99.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 393 aa  98.6  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 408 aa  98.2  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 359 aa  97.8  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 272 aa  97.4  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 389 aa  97.1  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 270 aa  97.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 305 aa  96.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  26.52 
 
 		 291 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 637 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  26.52 
 
 		 286 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 286 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  27.6 
 
 		 531 aa  95.1  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  26.52 
 
 		 286 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  26.52 
 
 		 286 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 360 aa  95.1  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  26.52 
 
 		 286 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  26.52 
 
 		 286 aa  95.1  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  26.52 
 
 		 286 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  26.52 
 
 		 286 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 285 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 285 aa  94.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 285 aa  94.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 280 aa  94.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  26.86 
 
 		 291 aa  94  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 270 aa  94  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 		 538 aa  94.4  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 414 aa  94  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  30.64 
 
 		 540 aa  94  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  27.35 
 
 		 322 aa  94  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 310 aa  93.6  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 406 aa  93.2  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 285 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 283 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  26.15 
 
 		 310 aa  92.8  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  32.6 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 421 aa  92.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 298 aa  92  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 297 aa  91.7  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  26.46 
 
 		 316 aa  91.3  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 283 aa  90.9  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  28.21 
 
 		 286 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  28.21 
 
 		 286 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  28.21 
 
 		 286 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  28.21 
 
 		 286 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 302 aa  90.9  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  28.21 
 
 		 286 aa  90.5  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 		 283 aa  90.5  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  26.46 
 
 		 534 aa  90.5  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 305 aa  90.1  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  30.93 
 
 		 385 aa  90.1  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  28.46 
 
 		 279 aa  90.1  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 287 aa  90.1  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  27.93 
 
 		 292 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 292 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0108  MscS mechanosensitive ion channel  25.26 
 
 		 304 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 		 305 aa  89.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 258 aa  90.1  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>