More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2381 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 		 493 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  62.19 
 
 		 493 aa  651    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 493 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  95.68 
 
 		 509 aa  997    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 493 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  61.91 
 
 		 514 aa  658    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 494 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 		 493 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 509 aa  1061    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 		 493 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 493 aa  652    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 		 494 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 		 493 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 		 493 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  83.53 
 
 		 505 aa  869    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 493 aa  618  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 494 aa  614  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 		 503 aa  609  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 485 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 484 aa  518  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 484 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 488 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 489 aa  481  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 492 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 492 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 500 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 495 aa  363  6e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 484 aa  360  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 490 aa  358  9.999999999999999e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 487 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 480 aa  355  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 482 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 484 aa  352  8.999999999999999e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 490 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 485 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 479 aa  346  7e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 502 aa  344  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 502 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 501 aa  342  7e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 470 aa  342  9e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 477 aa  341  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.72 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 507 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 495 aa  340  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 510 aa  340  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 491 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 503 aa  338  9e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 512 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 490 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 502 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 506 aa  335  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 471 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 490 aa  333  6e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 471 aa  332  7.000000000000001e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 509 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 468 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 516 aa  329  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 502 aa  329  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 484 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 473 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 474 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 491 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 494 aa  326  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 470 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 485 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 467 aa  323  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 480 aa  322  7e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 466 aa  322  8e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 511 aa  322  8e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 464 aa  322  8e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 474 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 474 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  36.04 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>