More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2300 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 118 aa  230  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 118 aa  230  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  95.76 
 
 		 118 aa  221  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  79.49 
 
 		 117 aa  184  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  79.49 
 
 		 117 aa  184  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  184  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 119 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  76.27 
 
 		 118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  74.58 
 
 		 118 aa  181  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  78.63 
 
 		 117 aa  181  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  180  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  180  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  180  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 119 aa  180  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 119 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  77.78 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  77.78 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  77.78 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  77.78 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  77.78 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  77.78 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  77.78 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  77.78 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  77.78 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  77.78 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  78.63 
 
 		 117 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  76.92 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  76.27 
 
 		 119 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  76.92 
 
 		 119 aa  177  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  74.58 
 
 		 118 aa  175  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  174  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  81.13 
 
 		 117 aa  172  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  74.78 
 
 		 117 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 		 119 aa  167  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 		 119 aa  167  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2906  50S ribosomal protein L20  79.66 
 
 		 119 aa  167  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499167  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 		 119 aa  167  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  71.19 
 
 		 119 aa  164  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02482  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  164  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118803  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  71.19 
 
 		 119 aa  164  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1715  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000852316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2622  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000215786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1823  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000424012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01685  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0124084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1926  ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000881806  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1958  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000226645  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1935  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000633644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2009  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.824907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1431  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00452751  normal  0.0170461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1837  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264555  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1447  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1464  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.41069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2434  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000769531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1475  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00112766  normal  0.994908 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2147  ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00368004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1916  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0615082  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01674  hypothetical protein  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0196333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1797  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588806  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1891  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2183  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0855617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1727  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  160  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.49225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1954  ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  160  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2050  ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  159  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  75.23 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 120 aa  159  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  67.52 
 
 		 119 aa  158  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 118 aa  157  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 119 aa  158  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  65.25 
 
 		 119 aa  157  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0875  50S ribosomal protein L20  76.07 
 
 		 117 aa  156  7e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000028916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  156  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1453  ribosomal protein L20  72.64 
 
 		 119 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 		 118 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 118 aa  156  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2767  50S ribosomal protein L20  72.64 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2640  50S ribosomal protein L20  72.64 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  67.52 
 
 		 119 aa  155  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  67.52 
 
 		 119 aa  155  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 		 119 aa  154  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 119 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 119 aa  153  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 119 aa  153  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 		 120 aa  153  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 119 aa  151  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 		 118 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 		 118 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  63.25 
 
 		 118 aa  150  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>