257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2202 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 		 257 aa  530  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  95.59 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  88.52 
 
 		 216 aa  391  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  57.14 
 
 		 195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  58.88 
 
 		 194 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  58.88 
 
 		 194 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1888  HesB/YadR/YfhF  55.61 
 
 		 196 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2009  hypothetical protein  53.92 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  55.84 
 
 		 194 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2344  HesB/YadR/YfhF-family protein  55.9 
 
 		 193 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2161  HesB/YadR/YfhF-family protein  58.38 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0420771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1985  IscR-regulated protein YhgI  58.38 
 
 		 194 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.858904  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2378  yhgI protein  57.87 
 
 		 194 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0102502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3317  HesB/YadR/YfhF-family protein  57.87 
 
 		 194 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1891  IscR-regulated protein YhgI  57.87 
 
 		 194 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2735  yhgI protein  56.92 
 
 		 197 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2466  HesB/YadR/YfhF:nitrogen-fixing NifU, C-terminal  56.92 
 
 		 197 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790017  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3104  HesB/YadR/YfhF  57.44 
 
 		 194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 191 aa  198  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 191 aa  198  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  51.28 
 
 		 191 aa  198  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 191 aa  198  6e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 191 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 191 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 191 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 191 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 191 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 191 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  49.23 
 
 		 191 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  49.23 
 
 		 191 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  49.23 
 
 		 191 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  49.23 
 
 		 191 aa  194  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  49.23 
 
 		 191 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  49.23 
 
 		 191 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  49.23 
 
 		 191 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  49.23 
 
 		 191 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  49.23 
 
 		 191 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4119  putative DNA uptake protein  49.74 
 
 		 191 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00614  putative DNA uptake protein  48.99 
 
 		 194 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  49.23 
 
 		 192 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  48.21 
 
 		 191 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001879  NfuA Fe-S protein maturation  49.49 
 
 		 194 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 191 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2293  putative DNA uptake protein  47.96 
 
 		 195 aa  192  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0106  putative DNA uptake protein  49.23 
 
 		 192 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.790621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  48.21 
 
 		 192 aa  191  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  47.18 
 
 		 191 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3880  putative DNA uptake protein  49.74 
 
 		 192 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4619  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 192 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4192  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 192 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4125  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 192 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4324  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 192 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0142  putative DNA uptake protein  50.26 
 
 		 192 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3794  putative DNA uptake protein  49.74 
 
 		 192 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100459  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  49.23 
 
 		 192 aa  188  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3804  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.472358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4003  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4233  putative DNA uptake protein  47.96 
 
 		 192 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2911  putative DNA uptake protein  46.97 
 
 		 194 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0244  putative DNA uptake protein  48.21 
 
 		 192 aa  184  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1491  putative DNA uptake protein  48.47 
 
 		 193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03996  putative DNA uptake protein  48.47 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  48.72 
 
 		 192 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0220  putative DNA uptake protein  44.39 
 
 		 192 aa  175  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.722098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3202  putative DNA uptake protein  44.16 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0161749 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0484  yhgI protein  39.49 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.508791  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  39.49 
 
 		 199 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  38.46 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2457  HesB/YadR/YfhF-family protein  37.69 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172331  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2172  thioredoxin-like protein  37.44 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2084  HesB/YadR/YfhF-family protein  37.44 
 
 		 199 aa  131  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.92431  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1723  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.29 
 
 		 204 aa  98.2  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.47 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  27.81 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  38.96 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.19 
 
 		 74 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  43.08 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.03 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  38.16 
 
 		 73 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  36.84 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  41.27 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.84 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.91 
 
 		 87 aa  53.9  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  39.39 
 
 		 80 aa  53.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  31.13 
 
 		 120 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  36.25 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 306 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.75 
 
 		 77 aa  52.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.44 
 
 		 190 aa  52.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  40.51 
 
 		 80 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.1 
 
 		 121 aa  52.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.33 
 
 		 198 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.57 
 
 		 120 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  32.05 
 
 		 195 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.46 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  40.58 
 
 		 103 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  34.18 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  33.75 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  30.1 
 
 		 121 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>