276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2034 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2034  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
234 aa  474  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1753  orotate phosphoribosyltransferase  92.31 
 
 
234 aa  438  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0521  orotate phosphoribosyltransferase  76.71 
 
 
224 aa  331  7.000000000000001e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.00908812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0619  orotate phosphoribosyltransferase  50.92 
 
 
215 aa  218  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000147946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0154  orotate phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 
213 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001826  orotate phosphoribosyltransferase  51.38 
 
 
213 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3835  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3964  orotate phosphoribosyltransferase  51.38 
 
 
213 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4255  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
215 aa  208  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0353  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
215 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.68295 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03499  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  208  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0295894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  208  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3851  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  208  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0069  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  208  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000170079  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4846  orotate phosphoribosyltransferase  51.38 
 
 
213 aa  208  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0116277  decreased coverage  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03451  hypothetical protein  50.46 
 
 
213 aa  208  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0214857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4143  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  208  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00122436  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3603  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
215 aa  208  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3776  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
215 aa  208  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.851332 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3977  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
213 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4067  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5012  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.127395  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0396  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0097  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
213 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0812826  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0457  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191717  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00649  orotate phosphoribosyltransferase  49.54 
 
 
224 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2590  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
214 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.431923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0371  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0370  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0382  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0587643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0113  orotate phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
221 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3843  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
213 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4159  orotate phosphoribosyltransferase  50.92 
 
 
215 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.041732  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0057  orotate phosphoribosyltransferase  50.92 
 
 
215 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0177997  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3487  orotate phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 
213 aa  205  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0051  orotate phosphoribosyltransferase  50.92 
 
 
215 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0379  orotate phosphoribosyltransferase  49.54 
 
 
213 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4394  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
213 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000864609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04047  orotate phosphoribosyltransferase  49.32 
 
 
213 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0080  orotate phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
213 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4567  orotate phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
213 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000210498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0216  orotate phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
213 aa  201  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4013  orotate phosphoribosyltransferase  49.54 
 
 
213 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4059  orotate phosphoribosyltransferase  49.54 
 
 
213 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3932  orotate phosphoribosyltransferase  49.54 
 
 
213 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0874196  hitchhiker  0.000146436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4120  orotate phosphoribosyltransferase  49.54 
 
 
213 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4105  orotate phosphoribosyltransferase  49.54 
 
 
213 aa  201  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00891654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0321  orotate phosphoribosyltransferase  49.54 
 
 
213 aa  201  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3950  orotate phosphoribosyltransferase  49.54 
 
 
213 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02880  orotate phosphoribosyltransferase  51.38 
 
 
213 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  46.4 
 
 
211 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3478  orotate phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 
213 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.972793  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3672  orotate phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.145212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0320  orotate phosphoribosyltransferase  49.09 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2998  orotate phosphoribosyltransferase  46.33 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
214 aa  196  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
219 aa  195  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0108  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
213 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0895164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3204  orotate phosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
234 aa  194  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5544  orotate phosphoribosyltransferase  50.23 
 
 
214 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3732  orotate phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
216 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.660148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0122  orotate phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
213 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70370  orotate phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 
213 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0181  orotate phosphoribosyltransferase  47.71 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0223943  hitchhiker  0.00000686039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5291  orotate phosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
213 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5340  orotate phosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
213 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.161962  hitchhiker  0.00942663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5199  orotate phosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
213 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6107  orotate phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
213 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
212 aa  188  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2740  orotate phosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
213 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4281  orotate phosphoribosyltransferase  47.49 
 
 
217 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4383  orotate phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
213 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0686  orotate phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
214 aa  184  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2485  orotate phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0225  orotate phosphoribosyltransferase  47.47 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.195509  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
219 aa  181  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  44.24 
 
 
215 aa  181  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0255  orotate phosphoribosyltransferase  44.04 
 
 
212 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0195  orotate phosphoribosyltransferase  46.72 
 
 
233 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2026  orotate phosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
245 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000542739  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0139  orotate phosphoribosyltransferase  44.89 
 
 
237 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1206  orotate phosphoribosyltransferase  43.44 
 
 
210 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0150  orotate phosphoribosyltransferase  45.58 
 
 
225 aa  174  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0035  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0041  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  44.8 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1212  orotate phosphoribosyltransferase  42.99 
 
 
211 aa  171  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4049  orotate phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000386035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
236 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0228  orotate phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
236 aa  169  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0181  orotate phosphoribosyltransferase  43.18 
 
 
213 aa  168  6e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  45 
 
 
513 aa  168  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2007  orotate phosphoribosyltransferase  43.05 
 
 
222 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05884  orotate phosphoribosyltransferase (Eurofung)  39.02 
 
 
241 aa  165  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0278  orotate phosphoribosyltransferase  44.14 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90848  orotate phosphoribosyltransferase  41.89 
 
 
219 aa  164  8e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03730  orotidine monophosphate pyrophosphorylase (URA5)  42.79 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  42.98 
 
 
237 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>