More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2007 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1727  replication restart DNA helicase PriA  92.43 
 
 		 789 aa  1515    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0573  primosomal protein N'  70.26 
 
 		 774 aa  1130    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0130712  hitchhiker  0.00834371 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2007  primosomal protein N'  100 
 
 		 793 aa  1635    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00478973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  42.97 
 
 		 739 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  43.09 
 
 		 739 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  43 
 
 		 739 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  43.26 
 
 		 739 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  42.24 
 
 		 746 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  43.28 
 
 		 739 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  43 
 
 		 739 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  43 
 
 		 739 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  42.95 
 
 		 743 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  42.73 
 
 		 733 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  43.06 
 
 		 744 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  41.81 
 
 		 733 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  43.04 
 
 		 740 aa  572  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  42.32 
 
 		 732 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  42.32 
 
 		 732 aa  565  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  42.32 
 
 		 732 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  43.19 
 
 		 731 aa  568  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  42.4 
 
 		 732 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  42.6 
 
 		 731 aa  564  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  42.4 
 
 		 732 aa  565  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  41.83 
 
 		 733 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3495  primosomal protein N'  42.69 
 
 		 736 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  42.4 
 
 		 732 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  42.53 
 
 		 732 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  42.06 
 
 		 732 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  42.06 
 
 		 732 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  42.73 
 
 		 739 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  42.53 
 
 		 732 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  41.94 
 
 		 732 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  41.85 
 
 		 732 aa  558  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  42.54 
 
 		 732 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  42.06 
 
 		 732 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  42.06 
 
 		 732 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0457  primosomal protein N'  42.95 
 
 		 736 aa  558  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  42.44 
 
 		 731 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  41.81 
 
 		 732 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  43.26 
 
 		 732 aa  558  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3672  primosomal protein N'  42.69 
 
 		 736 aa  558  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  42.65 
 
 		 732 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4122  primosomal protein N'  42.27 
 
 		 737 aa  550  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  42.34 
 
 		 742 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  42.58 
 
 		 732 aa  548  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0169  primosome assembly protein PriA  42.51 
 
 		 732 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  41.7 
 
 		 734 aa  548  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4426  primosomal protein N'  41.34 
 
 		 731 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  39.22 
 
 		 753 aa  542  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2694  transcription elongation factor GreA / replication restart DNA helicase PriA  39.97 
 
 		 736 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000288054  hitchhiker  0.00453215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  41.53 
 
 		 731 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  41.53 
 
 		 731 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  39.28 
 
 		 736 aa  535  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  41.47 
 
 		 731 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3356  primosomal protein N'  40.41 
 
 		 734 aa  534  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  41.53 
 
 		 731 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  40.88 
 
 		 731 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  41.4 
 
 		 731 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  40.08 
 
 		 731 aa  531  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  40.93 
 
 		 730 aa  529  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2239  primosome assembly protein PriA  40.49 
 
 		 733 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0379  primosomal protein N'  40.73 
 
 		 731 aa  525  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0445  primosomal protein N'  42.56 
 
 		 735 aa  525  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2149  primosome assembly protein PriA  40.31 
 
 		 733 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  40.2 
 
 		 733 aa  520  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  37.98 
 
 		 774 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  40.49 
 
 		 723 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  41.34 
 
 		 745 aa  514  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3601  primosome assembly protein PriA  40.62 
 
 		 732 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.550659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4366  primosomal protein N'  39.59 
 
 		 736 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04038  primosome assembly protein PriA  40.54 
 
 		 740 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4126  primosomal protein N'  38.06 
 
 		 743 aa  502  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000536083  hitchhiker  0.00000144445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0275  primosomal protein N'  40.03 
 
 		 737 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00025836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  40.46 
 
 		 738 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0799  primosomal protein N'  40.66 
 
 		 774 aa  498  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03519  primosome assembly protein PriA  38.07 
 
 		 729 aa  495  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.822304  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0166  primosome assembly protein PriA  39.12 
 
 		 704 aa  495  9.999999999999999e-139  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.331124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  38.74 
 
 		 725 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  39.62 
 
 		 725 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  39.62 
 
 		 725 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0248  primosomal protein N'  41.36 
 
 		 731 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000476665  normal  0.18889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  38.68 
 
 		 720 aa  479  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  38.68 
 
 		 720 aa  479  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2327  primosomal protein N'  37.28 
 
 		 734 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0753846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  37.55 
 
 		 724 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2672  replication restart DNA helicase PriA  37.65 
 
 		 738 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.868647 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  44.21 
 
 		 662 aa  445  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  35.8 
 
 		 754 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  44.21 
 
 		 662 aa  445  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  33.29 
 
 		 732 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  38.23 
 
 		 765 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2781  replication restart DNA helicase PriA  36.96 
 
 		 719 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  34.94 
 
 		 752 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  35.28 
 
 		 752 aa  428  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  38.73 
 
 		 765 aa  429  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.631062 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  35.65 
 
 		 758 aa  425  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3022  primosome assembly protein PriA  36.89 
 
 		 752 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3302  primosome assembly protein PriA  37.96 
 
 		 768 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.304002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3303  primosome assembly protein PriA  36.83 
 
 		 764 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3490  primosome assembly protein PriA  37.55 
 
 		 764 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000105942  normal  0.279843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>