More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1987 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 307 aa  637    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  91.46 
 
 		 294 aa  545  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  62.28 
 
 		 286 aa  351  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  58.72 
 
 		 286 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  58.72 
 
 		 286 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  56.79 
 
 		 299 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  59.79 
 
 		 287 aa  342  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 		 286 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 289 aa  331  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  53.64 
 
 		 296 aa  317  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  56.63 
 
 		 295 aa  309  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 296 aa  305  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 300 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  52.16 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  52.88 
 
 		 287 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 		 300 aa  292  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 287 aa  291  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  51.99 
 
 		 297 aa  285  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 		 291 aa  285  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  51.22 
 
 		 289 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  51.94 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  52.26 
 
 		 284 aa  279  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 287 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 		 288 aa  272  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 284 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 284 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 283 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  45.61 
 
 		 292 aa  268  8.999999999999999e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 284 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 281 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 282 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 282 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 		 283 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 291 aa  265  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  47.02 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 294 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 289 aa  261  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 287 aa  261  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 285 aa  261  8e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  51.22 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  47.77 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  48.14 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  48.41 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  48.25 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  46.13 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  48.59 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  46.5 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  45.36 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  47.87 
 
 		 289 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  48.42 
 
 		 307 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  48.41 
 
 		 287 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 294 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 		 289 aa  255  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  47.06 
 
 		 294 aa  254  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  46.1 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 		 288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  46.64 
 
 		 290 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.46 
 
 		 285 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 282 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  46.37 
 
 		 287 aa  252  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  45.94 
 
 		 288 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  42.52 
 
 		 309 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  47.54 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  47.81 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  45.94 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  46.71 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  47.54 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  47.35 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  47.35 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 301 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>