More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1909 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  100 
 
 		 355 aa  699    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  61.34 
 
 		 369 aa  424  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  49.49 
 
 		 316 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  48.47 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  44.07 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  43.39 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  43.39 
 
 		 317 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  41.56 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  44.83 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  47.72 
 
 		 314 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.2 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  44.91 
 
 		 345 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  46.69 
 
 		 314 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  45.07 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  44.44 
 
 		 335 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  41.87 
 
 		 332 aa  212  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  39.16 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  40.47 
 
 		 335 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  40.47 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  43.79 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  40.7 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  39.32 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  38.05 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  43.01 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  39.39 
 
 		 333 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  38.6 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  42.71 
 
 		 326 aa  185  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  35.14 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  39.06 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  38.72 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  35.87 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  34.83 
 
 		 336 aa  168  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  34.81 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  32.28 
 
 		 317 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  39.92 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  33.94 
 
 		 333 aa  159  9e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  34.05 
 
 		 350 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  32.42 
 
 		 415 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  37.67 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  32.71 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  37.84 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  32.71 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  32.71 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  32.71 
 
 		 354 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  32.71 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  32.71 
 
 		 354 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 		 354 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  37.5 
 
 		 316 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 		 354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  33.1 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  28.67 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  33.7 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  34.42 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  34.42 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  33.59 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  30.77 
 
 		 316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  31.78 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  31.03 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  31.23 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  23.48 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  26.57 
 
 		 355 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  34.01 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2443  transport system permease protein  28.46 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  33.64 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  24.9 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  28.14 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0973  iron-dicitrate transporter permease subunit  26.29 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.667352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  24.93 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0539  transport system permease protein  28.76 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.692668  normal  0.940815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  29.03 
 
 		 658 aa  63.5  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001070  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuC  31.06 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  27.47 
 
 		 704 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  24.91 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  26 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  22.48 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  27.78 
 
 		 672 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  27.46 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0304  transport system permease protein  26.97 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  24.81 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  28.76 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  28.76 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  28.76 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  23.53 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  26.41 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  23.53 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  24.3 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  25.93 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  28.47 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  24.52 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  25.89 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  30.11 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  27.31 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>