More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1904 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
133 aa  262  8.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  95.49 
 
 
133 aa  252  9e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.92 
 
 
133 aa  186  9e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.65 
 
 
133 aa  177  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.03 
 
 
138 aa  130  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.19 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.19 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.19 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.19 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.19 
 
 
176 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.36 
 
 
136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.36 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.7 
 
 
137 aa  123  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 
153 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.04 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.04 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.04 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.04 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.04 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.04 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.04 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.93 
 
 
178 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.35 
 
 
136 aa  117  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.73 
 
 
142 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.19 
 
 
139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.11 
 
 
135 aa  117  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  45.19 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  45.19 
 
 
172 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 
151 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 
158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  40.74 
 
 
140 aa  110  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.65 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.5 
 
 
138 aa  107  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 
151 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  37.5 
 
 
139 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
142 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.3 
 
 
141 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.11 
 
 
136 aa  104  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 
140 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 
152 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.65 
 
 
140 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 
136 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.58 
 
 
139 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.04 
 
 
137 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.37 
 
 
140 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  37.21 
 
 
143 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
140 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.68 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.38 
 
 
140 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1119  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.31 
 
 
144 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  38.35 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.04 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.43 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.01 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.56 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2118  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 
136 aa  97.1  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0526178  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0813  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
136 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1794  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 
141 aa  94.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.59 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  42.74 
 
 
173 aa  93.6  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 
140 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 
140 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 
140 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 
139 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.78 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  41.13 
 
 
167 aa  90.5  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.4 
 
 
151 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.82 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.11 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.218457 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  37.9 
 
 
152 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.82 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0751  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.3 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4354  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 
143 aa  86.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  34.71 
 
 
153 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1344  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.19 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0805  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.83 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  37.7 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  34.17 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3412  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.82 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.544248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0878  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.1 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0295235  normal  0.0766117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1022  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.1 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0335138  normal  0.0307792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  33.88 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>