159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1900 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  100 
 
 
185 aa  381  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  60.44 
 
 
183 aa  206  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  40.11 
 
 
171 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.42 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.46 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.34 
 
 
172 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.15 
 
 
165 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.67 
 
 
175 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.67 
 
 
175 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.68 
 
 
177 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.61 
 
 
172 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  41.22 
 
 
203 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.6 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  40.74 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  40.56 
 
 
184 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  35.93 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  35.52 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.33 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.93 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  36.91 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  37.93 
 
 
208 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  38.17 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.14 
 
 
190 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  44.55 
 
 
191 aa  90.9  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.3 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  45.37 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.1 
 
 
183 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  35.33 
 
 
175 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  34.81 
 
 
192 aa  88.6  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  34.93 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  41.6 
 
 
156 aa  87.8  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40 
 
 
169 aa  87.8  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  34.27 
 
 
172 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.1 
 
 
183 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.14 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.66 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  35.92 
 
 
170 aa  85.5  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.09 
 
 
239 aa  85.1  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.66 
 
 
171 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.25 
 
 
172 aa  85.1  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  38.62 
 
 
158 aa  84.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  36.69 
 
 
510 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.11 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.81 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.81 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.31 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  34.88 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.53 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  32.92 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.25 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  32.65 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.48 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.75 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.75 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.75 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.75 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.75 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  31.77 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  30.41 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.53 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.22 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  30.85 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  30.41 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.67 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.69 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.76 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.69 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  35.14 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  33.74 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  33.76 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  30.41 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  30.41 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  35.26 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  34.39 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  33.76 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  33.76 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  31.87 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  34.39 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  33.76 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  33.76 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  33.76 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  33.76 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  33.76 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  31.77 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28559  predicted protein  33.76 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000859292  hitchhiker  0.000000574282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  31.87 
 
 
162 aa  72  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.09 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.81 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.57 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.36 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  29.9 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.81 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.86 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.58 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0982  putative superoxide dismutase  31.79 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000174344  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.46 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  33.33 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.3 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  33.33 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>