187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1893 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
175 aa  366  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  87.93 
 
 
175 aa  330  8e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  72.99 
 
 
190 aa  283  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  74.14 
 
 
174 aa  281  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  75.14 
 
 
176 aa  281  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  70.76 
 
 
190 aa  270  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  68.39 
 
 
189 aa  262  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  64.91 
 
 
190 aa  251  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  63.53 
 
 
189 aa  246  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  62.35 
 
 
179 aa  231  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  59.17 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  57.65 
 
 
175 aa  220  9e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  59.88 
 
 
259 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  55.62 
 
 
182 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  55.62 
 
 
182 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  54.97 
 
 
184 aa  204  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  52.94 
 
 
188 aa  201  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  56.98 
 
 
251 aa  201  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  58.48 
 
 
238 aa  201  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  55.95 
 
 
181 aa  201  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  59.28 
 
 
243 aa  200  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  56.98 
 
 
243 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  58.68 
 
 
242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  56.98 
 
 
243 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  58.68 
 
 
243 aa  198  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  58.68 
 
 
243 aa  198  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  58.68 
 
 
243 aa  198  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  52.98 
 
 
179 aa  197  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  57.14 
 
 
242 aa  195  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  58.33 
 
 
247 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  57.31 
 
 
247 aa  195  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  57.49 
 
 
243 aa  195  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  57.31 
 
 
247 aa  195  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  55.56 
 
 
242 aa  194  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  56.89 
 
 
242 aa  194  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  56.98 
 
 
245 aa  194  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  56.73 
 
 
243 aa  192  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  56.14 
 
 
248 aa  191  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  56.89 
 
 
247 aa  191  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  56.89 
 
 
246 aa  191  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  53.49 
 
 
243 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  55.56 
 
 
247 aa  188  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  53.49 
 
 
245 aa  187  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  53.49 
 
 
248 aa  186  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  53.49 
 
 
248 aa  186  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  53.49 
 
 
243 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  55.56 
 
 
249 aa  185  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  52.91 
 
 
249 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  52.17 
 
 
233 aa  181  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  49.1 
 
 
159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  52.82 
 
 
157 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50 
 
 
157 aa  144  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  50.71 
 
 
178 aa  141  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  47.4 
 
 
157 aa  140  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.24 
 
 
157 aa  140  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  51.8 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  43.71 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50 
 
 
158 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  42.51 
 
 
157 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  50.35 
 
 
162 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  45.61 
 
 
167 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  43.11 
 
 
157 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  48.57 
 
 
157 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  45.61 
 
 
167 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  45.51 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  47.83 
 
 
157 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  47.83 
 
 
157 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  47.83 
 
 
157 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  46.53 
 
 
162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  46.58 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  44.12 
 
 
166 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  43.27 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  42.86 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.77 
 
 
159 aa  127  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  44.51 
 
 
169 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  48.23 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  43.67 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  48.2 
 
 
214 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.83 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  47.83 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  47.83 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3052  redoxin domain-containing protein  42.35 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  48.2 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  48.2 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  48.2 
 
 
214 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.12 
 
 
158 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  48.2 
 
 
214 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  48.2 
 
 
190 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  48.2 
 
 
185 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  47.48 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  40.94 
 
 
166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  42.2 
 
 
168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  46.38 
 
 
168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  42.2 
 
 
168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  43.36 
 
 
160 aa  124  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  46.1 
 
 
168 aa  124  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  42.35 
 
 
166 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>