More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1875 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  61.65 
 
 
555 aa  706  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  65.31 
 
 
545 aa  730  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.10473e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  67.53 
 
 
542 aa  770  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  66.54 
 
 
544 aa  730  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  85.74 
 
 
543 aa  979  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  69.52 
 
 
542 aa  778  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  64.15 
 
 
545 aa  723  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.06175e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  68.77 
 
 
543 aa  771  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  65.75 
 
 
545 aa  730  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.21418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  63.35 
 
 
545 aa  701  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  61.83 
 
 
555 aa  705  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  65.74 
 
 
546 aa  728  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  61.12 
 
 
553 aa  667  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  60 
 
 
552 aa  683  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  65.31 
 
 
545 aa  730  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.22232e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  64.27 
 
 
546 aa  712  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  63.28 
 
 
545 aa  702  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  63.65 
 
 
545 aa  712  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  2.80114e-09 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3084  CTP synthetase  63.84 
 
 
545 aa  705  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.46787e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  63.84 
 
 
545 aa  705  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.6445e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  63.47 
 
 
545 aa  709  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0945  CTP synthetase  61.34 
 
 
553 aa  660  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  64.02 
 
 
545 aa  715  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  59.27 
 
 
566 aa  662  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  59.78 
 
 
559 aa  689  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  68.96 
 
 
542 aa  779  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  61.21 
 
 
545 aa  716  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  65.38 
 
 
545 aa  732  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  65.75 
 
 
546 aa  729  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  8.91455e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  60.22 
 
 
547 aa  646  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2109  CTP synthetase  60.76 
 
 
552 aa  667  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  60.37 
 
 
552 aa  686  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  61.9 
 
 
553 aa  667  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  59.6 
 
 
554 aa  682  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  61.9 
 
 
553 aa  667  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  61.9 
 
 
553 aa  667  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  61.9 
 
 
570 aa  667  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  65.31 
 
 
545 aa  730  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.12535e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  61.72 
 
 
553 aa  665  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0218  CTP synthetase  58.97 
 
 
557 aa  650  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.682216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  60.19 
 
 
555 aa  671  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  64.68 
 
 
551 aa  733  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  67.53 
 
 
542 aa  770  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  63.55 
 
 
555 aa  732  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  64.64 
 
 
547 aa  734  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1236  CTP synthetase  65.31 
 
 
545 aa  730  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.61678e-07  hitchhiker  2.00253e-09 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  63.75 
 
 
550 aa  696  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4040  CTP synthetase  63.84 
 
 
545 aa  705  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.38941e-06  normal  0.515613 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2515  CTP synthetase  64.25 
 
 
546 aa  717  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3267  CTP synthetase  64.21 
 
 
545 aa  711  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0428959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3086  CTP synthetase  64.21 
 
 
545 aa  710  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35033  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03082  CTP synthetase  63.72 
 
 
543 aa  713  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  7.72842e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0915  CTP synthetase  59.82 
 
 
552 aa  679  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  67.29 
 
 
543 aa  763  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3443  CTP synthetase  60.4 
 
 
559 aa  683  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002506  CTP synthase  66.29 
 
 
546 aa  731  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.44608e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  66.54 
 
 
549 aa  753  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3546  CTP synthetase  64.02 
 
 
545 aa  708  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3387  CTP synthetase  64.39 
 
 
545 aa  709  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0942417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0817  CTP synthetase  64.02 
 
 
545 aa  706  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.351659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02587  hypothetical protein  63.84 
 
 
545 aa  705  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.48332e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0851  CTP synthetase  63.42 
 
 
545 aa  706  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.718725  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1065  CTP synthetase  62.39 
 
 
553 aa  675  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242214  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3111  CTP synthetase  64.21 
 
 
545 aa  711  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3150  CTP synthetase  64.21 
 
 
545 aa  711  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858121  normal  0.288938 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3169  CTP synthetase  64.02 
 
 
545 aa  710  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659472  normal  0.252968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2127  CTP synthetase  60.76 
 
 
552 aa  667  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0913295  normal  0.042023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3351  CTP synthetase  64.04 
 
 
545 aa  700  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.38422e-06  hitchhiker  2.52338e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  69.33 
 
 
542 aa  776  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.00969e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2918  CTP synthetase  63.84 
 
 
545 aa  705  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000134002  normal  0.938704 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0932  CTP synthetase  63.84 
 
 
545 aa  705  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000109112  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  63.35 
 
 
545 aa  701  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  58.23 
 
 
540 aa  635  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  69.52 
 
 
542 aa  777  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0614  CTP synthetase  60.41 
 
 
554 aa  672  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1176  CTP synthetase  58.15 
 
 
563 aa  644  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.413679 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0899  CTP synthetase  61.9 
 
 
558 aa  665  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.995561  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1448  CTP synthetase  60.04 
 
 
554 aa  649  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00174  CTP synthetase  60.77 
 
 
554 aa  676  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0969  CTP synthetase  62.75 
 
 
553 aa  675  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471871  normal  0.0231208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2562  CTP synthetase  60.22 
 
 
557 aa  661  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542571  normal  0.0982923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3093  CTP synthetase  63.84 
 
 
545 aa  705  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1441  CTP synthetase  61.41 
 
 
553 aa  676  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0566  CTP synthetase  60.41 
 
 
554 aa  672  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2019  CTP synthetase  60.58 
 
 
552 aa  665  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0440235 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  63.35 
 
 
545 aa  701  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  66.3 
 
 
543 aa  758  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  65.32 
 
 
545 aa  725  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  65.5 
 
 
545 aa  726  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1691  CTP synthetase  61.9 
 
 
553 aa  667  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202871  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  64.44 
 
 
542 aa  724  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  68.22 
 
 
543 aa  759  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  65.56 
 
 
546 aa  727  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1892  CTP synthetase  61.48 
 
 
553 aa  669  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1571  CTP synthetase  59.86 
 
 
557 aa  660  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465584  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  63.54 
 
 
545 aa  715  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  65.98 
 
 
548 aa  749  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  100 
 
 
544 aa  1129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1052  CTP synthetase  64.4 
 
 
549 aa  691  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  68.32 
 
 
543 aa  785  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>