More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1859 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  99.09 
 
 		 329 aa  672    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 329 aa  677    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1447  LysR family transcriptional regulator  93.62 
 
 		 329 aa  615  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000494272  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  62.06 
 
 		 314 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  61.41 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 314 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  60.77 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  61.64 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 315 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  56.27 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 314 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3385  LysR family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 316 aa  371  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.521059  normal  0.192926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1755  LysR family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 317 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 310 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.93 
 
 		 299 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.2 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 299 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  33.44 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.66 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2046  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3695  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  33.12 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 304 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 301 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  33.55 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  33.55 
 
 		 304 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 432 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  33.64 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  33.01 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2746  transcriptional regulator MexT  33.77 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32410  transcriptional regulator MexT  33.77 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  33.33 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5308  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35830  Regulatory protein, LysR-family  35.14 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4143  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00216178  hitchhiker  0.000662316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.55 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1710  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4833  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0352  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5282  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 316 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  30.46 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4022  putative LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0289175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3669  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2333  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0484  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  30.46 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  34.5 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>