19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1838 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1838  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  600  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00402348  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2360  hypothetical protein  67.12 
 
 
303 aa  354  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3496  membrane protein  48.78 
 
 
302 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1498  hypothetical protein  42.05 
 
 
300 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.378704  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1032  hypothetical protein  32.88 
 
 
293 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0528769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1804  hypothetical protein  34.57 
 
 
290 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0836595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1873  hypothetical protein  34.57 
 
 
293 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.593303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2773  hypothetical protein  31.18 
 
 
316 aa  99.4  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1065  hypothetical protein  33.2 
 
 
304 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1815  hypothetical protein  28.18 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1814  hypothetical protein  28.18 
 
 
298 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3384  hypothetical protein  28.31 
 
 
296 aa  59.3  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  32.12 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  32.12 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.12 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  31.39 
 
 
310 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  31.39 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  34.35 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>