249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1834 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1606  K+ uptake transporter, KtrA subunit  96.55 
 
 
233 aa  444  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000611134  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  31.39 
 
 
217 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  32 
 
 
215 aa  141  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  33.48 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  33.63 
 
 
220 aa  138  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  29.6 
 
 
215 aa  135  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  34.08 
 
 
221 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1833  TrkA-N domain protein  29.65 
 
 
244 aa  135  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  33.63 
 
 
221 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  34.08 
 
 
220 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  32.89 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  32.74 
 
 
233 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  30.94 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  32.74 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  32.29 
 
 
221 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  32.29 
 
 
221 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  32.29 
 
 
221 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  32.29 
 
 
221 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  32.29 
 
 
221 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  32.29 
 
 
221 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  32.29 
 
 
221 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  32.29 
 
 
221 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  32.29 
 
 
221 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  28.25 
 
 
217 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  32.74 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0313  TrkA domain-containing protein  31.53 
 
 
230 aa  125  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000239618  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  32.29 
 
 
221 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  30.04 
 
 
217 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  28.26 
 
 
220 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  28.26 
 
 
220 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  29.73 
 
 
222 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  30.8 
 
 
223 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  30.63 
 
 
222 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  28.63 
 
 
219 aa  121  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  27.56 
 
 
218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  27.48 
 
 
216 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  31.11 
 
 
231 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  27.43 
 
 
218 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  30.97 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  31.82 
 
 
221 aa  113  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  27.8 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  28.25 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  29.78 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  28.44 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  27.11 
 
 
231 aa  108  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  29.52 
 
 
217 aa  108  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  31.02 
 
 
221 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  30.9 
 
 
223 aa  106  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0807  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 
234 aa  106  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3603  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
229 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  25.45 
 
 
218 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  27.56 
 
 
232 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  29.86 
 
 
220 aa  104  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  28 
 
 
216 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  29.78 
 
 
222 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  24.78 
 
 
219 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  28.96 
 
 
221 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  31.02 
 
 
217 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  27.15 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  29.63 
 
 
217 aa  99.4  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 
213 aa  99  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  26.7 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  24.55 
 
 
224 aa  98.2  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 
221 aa  98.2  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0058  potassium uptake protein, putative  32.1 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  27.65 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0055  TrkA domain-containing protein  32.1 
 
 
232 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000827601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  26.13 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  25.55 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0047  TrkA domain-containing protein  28.63 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  32.1 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  32.1 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  26.79 
 
 
223 aa  95.5  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  32.1 
 
 
232 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000156349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0050  TrkA domain-containing protein  31.48 
 
 
232 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2069  TrkA-N domain protein  25.22 
 
 
228 aa  95.1  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
222 aa  95.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  25.34 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  27.56 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  27.56 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  22.57 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  25 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  32.18 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  25.76 
 
 
220 aa  93.6  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  25.45 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  26.7 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  22.81 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  24.77 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  25.23 
 
 
220 aa  92.4  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  25.11 
 
 
220 aa  92.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  25.91 
 
 
218 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  24.89 
 
 
230 aa  92  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  30.86 
 
 
217 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0054  TrkA-N domain protein  31.17 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  25.45 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  25 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4304  TrkA domain-containing protein  31.17 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.333456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>