215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1831 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 834 aa  1701    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  49.34 
 
 		 775 aa  723    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  42.84 
 
 		 783 aa  555  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.68 
 
 		 790 aa  515  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.19 
 
 		 794 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.69 
 
 		 748 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.16 
 
 		 816 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  33.29 
 
 		 786 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.68 
 
 		 781 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.39 
 
 		 785 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  34.65 
 
 		 842 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  34.69 
 
 		 766 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  34.42 
 
 		 766 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  34.81 
 
 		 803 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  34.42 
 
 		 766 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  34.68 
 
 		 984 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  34.68 
 
 		 766 aa  386  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  34.55 
 
 		 766 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.33 
 
 		 797 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.2 
 
 		 765 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.85 
 
 		 797 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.08 
 
 		 849 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.29 
 
 		 808 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  32.52 
 
 		 766 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.48 
 
 		 782 aa  350  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  32.4 
 
 		 810 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  32.4 
 
 		 803 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  32.35 
 
 		 790 aa  348  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  32.4 
 
 		 782 aa  347  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  32.4 
 
 		 803 aa  347  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.93 
 
 		 789 aa  345  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  32.27 
 
 		 803 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  32.22 
 
 		 790 aa  343  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.07 
 
 		 788 aa  341  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  32.04 
 
 		 814 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.04 
 
 		 807 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.46 
 
 		 794 aa  325  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  29.46 
 
 		 815 aa  319  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.46 
 
 		 815 aa  319  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  29.2 
 
 		 815 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.64 
 
 		 786 aa  308  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  28.57 
 
 		 754 aa  268  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  27.89 
 
 		 804 aa  265  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.18 
 
 		 791 aa  261  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.55 
 
 		 778 aa  261  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.72 
 
 		 798 aa  237  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  28.27 
 
 		 765 aa  231  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  27.1 
 
 		 788 aa  219  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  24.58 
 
 		 834 aa  178  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.19 
 
 		 734 aa  164  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.7 
 
 		 778 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.84 
 
 		 778 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.78 
 
 		 778 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  23.62 
 
 		 814 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.19 
 
 		 832 aa  94.4  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  23.01 
 
 		 865 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.14 
 
 		 880 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  23.65 
 
 		 914 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  23.9 
 
 		 913 aa  90.1  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  23.65 
 
 		 914 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.23 
 
 		 831 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.6 
 
 		 859 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  23.98 
 
 		 836 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0934  fimbrial usher protein  22.29 
 
 		 826 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.37 
 
 		 837 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  22.24 
 
 		 939 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  23.77 
 
 		 836 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  23.73 
 
 		 837 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2399  fimbrial usher protein  22.14 
 
 		 826 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.56 
 
 		 857 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  24.08 
 
 		 888 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  24.59 
 
 		 833 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  23.76 
 
 		 850 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  23.18 
 
 		 851 aa  75.1  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  23.93 
 
 		 836 aa  74.7  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  20.95 
 
 		 853 aa  74.3  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  23.1 
 
 		 833 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.85 
 
 		 838 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  23.6 
 
 		 833 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  25.85 
 
 		 863 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  23.89 
 
 		 836 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  20.95 
 
 		 853 aa  74.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.61 
 
 		 823 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.35 
 
 		 837 aa  73.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  21.54 
 
 		 853 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  21.13 
 
 		 853 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.51 
 
 		 838 aa  72.8  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  25.51 
 
 		 838 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  21 
 
 		 853 aa  72  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  25.51 
 
 		 838 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  25.51 
 
 		 838 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2118  fimbrial usher family protein  21.02 
 
 		 740 aa  72  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.167309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3926  putative fimbrial usher protein FanD  22 
 
 		 785 aa  72  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.540204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  25.51 
 
 		 838 aa  72  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1455  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.37 
 
 		 841 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2384  fimbrial usher protein  21.67 
 
 		 829 aa  71.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0771751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2295  fimbrial usher protein  21.67 
 
 		 829 aa  70.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  22.64 
 
 		 844 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  21.52 
 
 		 871 aa  68.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0084  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.2 
 
 		 818 aa  67.8  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>