More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1732 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  94.33 
 
 
547 aa  1077    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0865  cardiolipin synthetase  57.51 
 
 
589 aa  636    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000163382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  100 
 
 
555 aa  1149    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  36.33 
 
 
485 aa  333  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  36.04 
 
 
484 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  36.14 
 
 
492 aa  332  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  37.71 
 
 
532 aa  331  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  36.93 
 
 
484 aa  329  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  36.42 
 
 
484 aa  326  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  35.48 
 
 
490 aa  325  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  34.98 
 
 
491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  35.31 
 
 
485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 
486 aa  317  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.23 
 
 
486 aa  317  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 
486 aa  317  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 
486 aa  317  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  35.23 
 
 
486 aa  317  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 
486 aa  317  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  36.07 
 
 
486 aa  317  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  35.23 
 
 
486 aa  317  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  35.04 
 
 
486 aa  316  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  34.67 
 
 
492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  35.11 
 
 
486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  35.11 
 
 
486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  35.11 
 
 
486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  35.11 
 
 
486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  35.11 
 
 
486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  34.92 
 
 
484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  35.04 
 
 
486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  34.27 
 
 
486 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  36.07 
 
 
486 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  35.88 
 
 
486 aa  309  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  34.56 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  35.15 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  35.15 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  36.47 
 
 
484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  35.21 
 
 
486 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  35.08 
 
 
486 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  34.96 
 
 
483 aa  291  2e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  33.92 
 
 
478 aa  261  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  31.23 
 
 
479 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  30.84 
 
 
479 aa  248  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  31.25 
 
 
478 aa  233  9e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.21 
 
 
479 aa  225  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  31.47 
 
 
491 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.54 
 
 
491 aa  217  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.79 
 
 
481 aa  217  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  29.43 
 
 
476 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.84 
 
 
467 aa  213  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  29.82 
 
 
476 aa  211  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  29.88 
 
 
489 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  29.76 
 
 
475 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.66 
 
 
472 aa  200  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  28.27 
 
 
495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  30.34 
 
 
467 aa  195  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  30.34 
 
 
467 aa  194  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  27.98 
 
 
514 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.34 
 
 
483 aa  192  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  27.79 
 
 
514 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  29.96 
 
 
472 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  27.79 
 
 
514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  27.79 
 
 
514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  27.79 
 
 
514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  27.79 
 
 
514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  27.79 
 
 
514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  28.19 
 
 
470 aa  188  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.4 
 
 
481 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  27.82 
 
 
473 aa  186  7e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  29.69 
 
 
482 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  27.07 
 
 
487 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.3 
 
 
484 aa  183  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.54 
 
 
526 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  28.57 
 
 
499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  27.72 
 
 
509 aa  181  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  29.46 
 
 
471 aa  180  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  28.63 
 
 
477 aa  180  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  29.01 
 
 
502 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  29.63 
 
 
484 aa  178  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  28.54 
 
 
486 aa  177  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  27.58 
 
 
509 aa  177  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  27.38 
 
 
509 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  27.38 
 
 
509 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  27.72 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  26.89 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  26.89 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.02 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  27.69 
 
 
485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  28.52 
 
 
481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  26.89 
 
 
490 aa  172  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.78 
 
 
474 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1291  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.8 
 
 
509 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.36 
 
 
472 aa  171  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.4 
 
 
486 aa  171  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.43 
 
 
477 aa  170  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.51 
 
 
395 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0934  phospholipase D/transphosphatidylase  26.1 
 
 
468 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  28.02 
 
 
490 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1396  phospholipase D/transphosphatidylase  24.76 
 
 
514 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.704033  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  25.56 
 
 
497 aa  168  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  26.74 
 
 
505 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>