42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1702 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1702  SOUL heme-binding protein  100 
 
 
220 aa  454  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.047205  normal  0.584575 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1414  SOUL heme-binding protein  49.48 
 
 
187 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2926  SOUL heme-binding protein  41.95 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824074  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2389  SOUL heme-binding protein  41.8 
 
 
205 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298504  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2940  SOUL heme-binding protein  41.95 
 
 
212 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681115  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2896  SOUL heme-binding protein  41.95 
 
 
212 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1785  SOUL heme-binding protein  40.09 
 
 
211 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.216897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2357  SOUL heme-binding protein  39.8 
 
 
196 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1732  SOUL heme-binding protein  42.23 
 
 
218 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0388599  normal  0.579587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3219  SOUL heme-binding protein  37.26 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918891  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2884  SOUL heme-binding protein  39.71 
 
 
212 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0215934  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2407  SOUL heme-binding protein  38.53 
 
 
213 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0124  SOUL heme-binding protein  40.1 
 
 
189 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2155  SOUL heme-binding protein  38.83 
 
 
206 aa  145  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.798949  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3628  SOUL heme-binding protein  36.32 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146783  normal  0.903477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5978  heme-binding protein  38.95 
 
 
204 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2804  SOUL heme-binding protein  36.63 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1349  putative SOUL heme-binding protein  37.7 
 
 
211 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0086  SOUL heme-binding protein  35.79 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502327  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2566  SOUL heme-binding protein  34.29 
 
 
198 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0552192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0404  SOUL heme-binding protein  35.12 
 
 
204 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.460046  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3441  SOUL heme-binding protein  34.3 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0544  SOUL heme-binding protein  47.97 
 
 
115 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.301676  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0891  SOUL heme-binding protein  36.13 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1935  SOUL heme-binding protein  31.88 
 
 
208 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0157  SOUL heme-binding protein  37.43 
 
 
179 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4115  SOUL heme-binding protein  32.7 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.721347  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1033  SOUL heme-binding protein  33.85 
 
 
192 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1279  SOUL heme-binding protein  37.08 
 
 
211 aa  106  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0864  hypothetical protein  33.51 
 
 
197 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2524  SOUL heme-binding protein  32.98 
 
 
179 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3007  SOUL heme-binding protein  30.54 
 
 
197 aa  98.6  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2304  SOUL heme-binding protein  30.61 
 
 
166 aa  90.9  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00025626  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1687  hypothetical protein  31.96 
 
 
172 aa  91.3  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00350109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1762  SOUL heme-binding protein  28.78 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0854  SOUL heme-binding protein  31.79 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46002  predicted protein  33.66 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0390723  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35858  predicted protein  33.66 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000296008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4266  SOUL heme-binding protein  29.27 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.409144 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40872  predicted protein  31.5 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.471917 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30678  predicted protein  26.13 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800735  normal  0.996732 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37136  predicted protein  26.17 
 
 
412 aa  62  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>