55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1626 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  100 
 
 		 911 aa  1900    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  40.55 
 
 		 591 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  40.81 
 
 		 631 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  40.92 
 
 		 582 aa  435  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  37.33 
 
 		 689 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  35.64 
 
 		 890 aa  351  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  35.64 
 
 		 890 aa  351  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  34.04 
 
 		 953 aa  340  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  33.86 
 
 		 958 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  33.86 
 
 		 958 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  34.04 
 
 		 953 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  33.86 
 
 		 950 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  33.86 
 
 		 955 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  33.86 
 
 		 950 aa  336  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  33.69 
 
 		 955 aa  334  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  34.62 
 
 		 895 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  34.75 
 
 		 580 aa  296  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  33.57 
 
 		 930 aa  284  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  32.84 
 
 		 676 aa  281  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  31.62 
 
 		 633 aa  270  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  32.3 
 
 		 841 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  30.04 
 
 		 929 aa  256  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  30.63 
 
 		 711 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  29.23 
 
 		 979 aa  253  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  29.98 
 
 		 845 aa  247  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  47.86 
 
 		 280 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  32.78 
 
 		 515 aa  245  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  34.39 
 
 		 627 aa  244  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  30.59 
 
 		 658 aa  241  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  28.57 
 
 		 899 aa  238  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  31.13 
 
 		 1051 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  27.99 
 
 		 878 aa  219  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.2 
 
 		 713 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  36.58 
 
 		 295 aa  197  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  25.86 
 
 		 556 aa  174  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  27.21 
 
 		 553 aa  168  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  27.12 
 
 		 574 aa  165  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  26.34 
 
 		 443 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  29.83 
 
 		 842 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  31.75 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  24.72 
 
 		 709 aa  92.8  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  25.43 
 
 		 580 aa  92  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  27.63 
 
 		 987 aa  74.3  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  26.04 
 
 		 624 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  26.32 
 
 		 597 aa  71.2  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  26.32 
 
 		 597 aa  71.2  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.36 
 
 		 970 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.05 
 
 		 970 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  25.55 
 
 		 597 aa  67.4  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2286  hypothetical protein  35.78 
 
 		 125 aa  66.6  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  27.03 
 
 		 897 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  27.97 
 
 		 298 aa  51.2  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  27.97 
 
 		 298 aa  51.2  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2724  hypothetical protein  26.85 
 
 		 127 aa  50.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>