44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1616 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  100 
 
 
400 aa  829    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  43.92 
 
 
394 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  40 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  36.5 
 
 
407 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  36.87 
 
 
407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  32.84 
 
 
380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  31.26 
 
 
388 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  28.5 
 
 
405 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  28.46 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  26.07 
 
 
417 aa  126  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  25.81 
 
 
428 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  28.72 
 
 
438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  27.91 
 
 
422 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  28.68 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  29.06 
 
 
421 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  28.09 
 
 
433 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  24.38 
 
 
435 aa  104  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  25.42 
 
 
465 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  24.68 
 
 
456 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  24.56 
 
 
425 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  24.94 
 
 
422 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  25 
 
 
435 aa  93.6  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  24.87 
 
 
451 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  26.63 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  23.63 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  23.47 
 
 
459 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  25.17 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  23.67 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  23.93 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  24.64 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  24.02 
 
 
448 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  23.8 
 
 
448 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  21.1 
 
 
454 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  21.65 
 
 
456 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  28.3 
 
 
449 aa  57.4  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  24.59 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  30.97 
 
 
430 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  30.23 
 
 
437 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  21.61 
 
 
367 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  21.61 
 
 
367 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  35.24 
 
 
666 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3170  putative abortive phage resistance  28.18 
 
 
488 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  32.93 
 
 
315 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  21.39 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>