141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1600 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  100 
 
 		 299 aa  579  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  98.66 
 
 		 299 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  85.47 
 
 		 299 aa  481  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  61.62 
 
 		 298 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  60.94 
 
 		 298 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  60.94 
 
 		 298 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  60.94 
 
 		 298 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  60.61 
 
 		 298 aa  341  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  62.29 
 
 		 294 aa  338  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  60.14 
 
 		 295 aa  335  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  61.28 
 
 		 298 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  60.62 
 
 		 295 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  60.94 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  60.61 
 
 		 298 aa  332  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  60.61 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  60.61 
 
 		 336 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  60.61 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  60.61 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  60.61 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  60.61 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  60.61 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  60.14 
 
 		 302 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  59.8 
 
 		 302 aa  326  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  61.3 
 
 		 303 aa  325  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  58.78 
 
 		 293 aa  318  7e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  61.99 
 
 		 313 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  59.26 
 
 		 296 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  59.26 
 
 		 296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  56.67 
 
 		 312 aa  309  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  53.72 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  58.05 
 
 		 296 aa  298  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  56.48 
 
 		 300 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  53.72 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  53.04 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  55.67 
 
 		 292 aa  278  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  52.51 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  53.45 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  50.86 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  52.07 
 
 		 294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  50.86 
 
 		 294 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  50.85 
 
 		 315 aa  266  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  50.86 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  53.1 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  48.23 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  50.84 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  47.49 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  48.97 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 325 aa  228  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  45.57 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  42.66 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  44.33 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  45.48 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  42.55 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  44.9 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  45.36 
 
 		 640 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  42.23 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  39.79 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  40.62 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  40.27 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  39.93 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.93 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  40.5 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.29 
 
 		 297 aa  181  9.000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.21 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  43 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  42.09 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.8 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.24 
 
 		 584 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  55.67 
 
 		 120 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  26.21 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  26.21 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  25.73 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  25.73 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  26.21 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  25.73 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  28.51 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  33.08 
 
 		 317 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 400 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2578  ABC transporter permease  25.35 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  27.93 
 
 		 352 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.86 
 
 		 471 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  24.75 
 
 		 388 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  27.16 
 
 		 391 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  26.6 
 
 		 357 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  27.57 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>