142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1373 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  100 
 
 
336 aa  689    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  72.09 
 
 
330 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  62.35 
 
 
334 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  59.2 
 
 
330 aa  385  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  52.76 
 
 
337 aa  341  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  53.82 
 
 
333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  97.16 
 
 
141 aa  280  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  43.83 
 
 
332 aa  279  6e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  46.15 
 
 
319 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  42.81 
 
 
329 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  42.07 
 
 
327 aa  261  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  39.45 
 
 
324 aa  248  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  39.45 
 
 
324 aa  248  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  42.37 
 
 
328 aa  246  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  42.37 
 
 
326 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  38.87 
 
 
328 aa  238  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  43.58 
 
 
210 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  41.26 
 
 
198 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  43.72 
 
 
192 aa  157  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1088  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  57.02 
 
 
354 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  53.17 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  54.07 
 
 
344 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  52.38 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  50.79 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  52.31 
 
 
343 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  50.77 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  47.52 
 
 
281 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  50.41 
 
 
291 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  46.85 
 
 
353 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  47.58 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  55 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  50.41 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  43.92 
 
 
337 aa  133  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  45.65 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  49.61 
 
 
358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  49.59 
 
 
342 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  47.93 
 
 
344 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  50 
 
 
369 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  44 
 
 
366 aa  129  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  49.61 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  48.76 
 
 
350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  47.93 
 
 
344 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  46.72 
 
 
365 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  45.59 
 
 
256 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  44.62 
 
 
345 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  44.62 
 
 
345 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  48.03 
 
 
350 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.7 
 
 
186 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  47.24 
 
 
356 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  49.18 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  46.67 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  43.28 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  47.86 
 
 
126 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  51.28 
 
 
127 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  48.31 
 
 
144 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  44.63 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  44.19 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  45.83 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  42.98 
 
 
359 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  43.9 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  39.71 
 
 
242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  46.28 
 
 
356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  45.61 
 
 
135 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  49.14 
 
 
340 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  45.69 
 
 
120 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  39.86 
 
 
340 aa  106  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  40.5 
 
 
352 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  41.44 
 
 
361 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  42.98 
 
 
338 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  39.67 
 
 
336 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  39.52 
 
 
336 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  42.28 
 
 
331 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  38.71 
 
 
334 aa  99.8  6e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  40.5 
 
 
335 aa  99.4  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  37.4 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  41 
 
 
121 aa  92.8  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  34.59 
 
 
355 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  34.59 
 
 
355 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  35.54 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  63.08 
 
 
81 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  37.5 
 
 
333 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  33.6 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  31.5 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  30.4 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  31.5 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  30.4 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  30.71 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  47.22 
 
 
108 aa  74.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0517  prophage maintenance system killer protein  45.95 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  56.86 
 
 
164 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  52.63 
 
 
130 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  35.62 
 
 
81 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  46.03 
 
 
105 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  38.04 
 
 
129 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  32.56 
 
 
90 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  48.28 
 
 
123 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  40.91 
 
 
132 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  50 
 
 
55 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>